行政机关自查自纠撤销原行政行为后重新作出行政行为，能否主张国家赔偿需分情况讨论，具体分析如下：

一、若原行政行为违法且造成损害，撤销后重新作出合法行为，仍可主张赔偿

1. 法律逻辑
   根据《国家赔偿法》第四条，行政机关及其工作人员在行使职权时违法侵犯财产权或人身权的，受害人有权取得赔偿。若原行政行为已被确认违法（如通过行政复议、行政诉讼或自查自纠程序），且该行为直接导致公民、法人或其他组织合法权益受损（如错误罚款、强制拆除合法建筑等），即使行政机关后续撤销原行为并重新作出合法行为，原行为造成的损害仍需通过国家赔偿程序救济。

2. 典型场景

   • 行政机关错误征收土地，后自行撤销征收决定并退还土地，但被征收人已因征收行为遭受农作物损失、搬迁费用等直接经济损失。
     
   • 行政机关错误吊销营业执照，后恢复执照但企业已因停业期间产生员工工资、合同违约等损失。

二、若重新作出的行为仍违法或扩大损害，可主张赔偿范围扩大

1. 法律逻辑
   若行政机关撤销原行为后，重新作出的行政行为仍存在违法性（如程序违法、实体认定错误），或新行为进一步扩大了损害后果（如重复处罚、超范围强制执行），则受害人可就原行为与新行为共同造成的损害主张赔偿。此时需通过行政复议或行政诉讼确认新行为的违法性，再启动赔偿程序。

2. 典型场景

   • 行政机关以“程序瑕疵”为由撤销原处罚决定，但重新作出的处罚决定加重了罚款金额，受害人可就新增罚款部分主张赔偿。
     
   • 行政机关错误拆除房屋后，重新作出的补偿决定未涵盖屋内物品损失，受害人可就物品损失单独主张赔偿。

三、若原行为合法或未造成实际损害，撤销后重新作出行为通常不赔

1. 法律逻辑
   国家赔偿以“违法行使职权”且“造成实际损害”为前提。若原行政行为本身合法（如基于正确事实和法律作出的处罚），或虽被撤销但未对相对人权益产生实际影响（如未执行的警告处罚），则撤销行为不触发赔偿义务。同理，重新作出的合法行为亦不产生赔偿问题。

2. 典型场景

   • 行政机关因“证据不足”撤销原处罚决定，但后续补充证据后重新作出相同处罚，且新处罚经司法审查确认合法，此时相对人无权主张赔偿。
     
   • 行政机关撤销未实际执行的行政强制措施（如未实际查封的场所），相对人未因该措施遭受财产或人身损害，不满足赔偿条件。

四、实务操作建议

1. 固定证据链
   及时收集原行政行为违法性的证据（如行政决定书、复议/诉讼文书）、损害后果的证据（如财务凭证、鉴定报告）及新行为违法性的证据（如程序违规记录、实体矛盾点）。

2. 分步主张权利

   • 第一步：通过行政复议或行政诉讼确认原行为/新行为的违法性；
     
   • 第二步：向赔偿义务机关（作出原行为的行政机关）提出书面赔偿申请；
     
   • 第三步：若对赔偿决定不服，可在收到决定之日起3个月内向法院提起行政赔偿诉讼。

3. 注意时效限制
   国家赔偿请求时效为2年，自知道或应当知道国家机关及其工作人员行使职权时的行为侵犯人身权、财产权之日起计算。若涉及多个行为，时效分别计算。

总结：能否主张国家赔偿需结合原行为与新行为的合法性、损害实际发生情况综合判断。建议根据具体案情，携带相关材料向我进一步咨询，我将结合证据细节制定维权策略。