当员工以未签订劳动合同为由提出要起诉您，并要求补偿时，作为用人单位，您需要采取一系列系统而全面的措施来应对。以下是我为您详细梳理的应对策略：
一、首要行动：立即沟通与协商
- 主动沟通：第一时间与员工进行真诚、友好的沟通，承认在劳动合同签订流程上的疏忽，并表达出解决问题的诚意。
- 提出补偿方案：根据实际情况，提出一个合理的补偿方案，比如额外支付一定金额的补偿金或提供其他福利，以争取员工的理解和同意，从而避免法律纠纷。
- 补签劳动合同：在协商过程中，尽快与员工补签劳动合同，确保合同内容完整、合法，并注明该合同是对之前未签合同期间劳动关系的确认和补充。
二、证据收集与分析
- 证明劳动关系存在：收集工资支付记录、工作证、考勤记录、同事证言、工作成果等能够证明劳动关系存在的证据。这些证据对于后续的法律程序至关重要。
- 分析未签合同原因：仔细剖析未签劳动合同的具体原因，无论是内部管理混乱还是员工自身原因，都要收集相关证据以备不时之需。
- 评估赔偿责任：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，计算用工时长，以准确评估可能承担的经济赔偿责任，如双倍工资等。
三、法律程序应对
- 尊重法律程序：若员工坚持提起诉讼，您应尊重法律程序，积极配合法院或劳动仲裁机构的工作，按时提交答辩状、证据材料等相关文件。
- 寻求专业法律帮助：咨询专业的劳动法律师或法律专家，获取详细的法律建议和应对策略。律师的专业指导将有助于您制定合理的应对方案，维护合法权益。
四、完善管理制度与预防
- 加强劳动合同管理：完善公司的劳动合同管理制度，加强对劳动合同签订的管理和监督，确保所有新员工入职时都及时签订书面劳动合同，并定期检查和更新现有员工的劳动合同。
- 提升法律意识：定期对人力资源管理人员进行劳动法律法规的培训，提高其法律意识和合同管理能力。同时，通过培训增强员工对劳动合同重要性的认识，促进公司内部的合规文化。
五、关于补偿的具体说明
如果员工最终通过法律途径获得了补偿判决，您需要根据判决结果支付相应的补偿金。补偿金的具体数额将根据员工的工资水平、用工时长以及相关法律法规的规定来确定。一般来说，如果未签劳动合同的时长超过一个月但不满一年，您可能需要支付员工双倍工资作为补偿；如果时长超过一年，则视为已签订无固定期限劳动合同，但您仍需支付从用工满一个月的次日至满一年的前一日的双倍工资。
综上所述，面对员工以未签劳动合同为由提出的起诉和补偿要求，您应积极采取补救措施，通过协商、收集证据、评估赔偿责任、积极应对法律程序和完善管理制度等方式来全面解决问题。这不仅有助于维护您的合法权益，还能促进公司内部管理的规范化和法治化。