结论：根据您描述的情况，合同上写明转正税前工资为3500元，但实际每月只发放几百元，这很可能是不合法的。不过，具体是否合法还需结合合同的具体条款、实际履行情况以及相关法律法规来综合判断。

分析：

1. 合同条款的约束力：

   • 合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。如果合同中明确约定了转正后的税前工资为3500元，那么这一条款对双方都具有约束力。
   • 雇主应当按照合同约定支付工资，不得随意降低或克扣。

2. 实际履行与合同约定的差异：

   • 如果实际发放的工资与合同约定的工资存在显著差异，且这种差异没有合理的解释或依据，那么雇主的行为可能构成违约。
   • 在这种情况下，您有权要求雇主按照合同约定支付工资，并可能寻求法律救济，如提起劳动仲裁或诉讼。

3. 相关法律法规的适用：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，雇主应当按时足额支付劳动者工资，不得克扣或者无故拖欠。
   • 如果雇主违反这些规定，劳动者有权向劳动行政部门投诉，要求雇主支付拖欠的工资，并可能获得相应的赔偿。

4. 可能存在的例外情况：

   • 当然，也存在一些例外情况，如合同中可能约定了某些条件下工资可以调整，或者实际工作中存在某些特殊情况导致工资发放减少（如请假、旷工等）。
   • 但这些例外情况都需要在合同中有明确约定，并且需要符合相关法律法规的规定。

建议：

1. 审查合同条款：

   • 首先，仔细审查合同中的工资条款，确认是否存在关于工资调整、扣除等特殊约定。

2. 与雇主沟通：

   • 如果发现合同条款与实际发放工资存在差异，建议与雇主进行沟通，了解原因并要求按照合同约定支付工资。

3. 寻求法律救济：

   • 如果沟通无果，或者雇主拒绝按照合同约定支付工资，您可以考虑向劳动行政部门投诉，或者提起劳动仲裁、诉讼等法律程序来维护自己的合法权益。

注意事项：

• 在采取任何法律行动之前，请确保您已经收集了足够的证据来支持您的主张，如合同、工资条、银行流水等。
• 如果您对法律程序不熟悉，或者担心自己的权益无法得到有效保障，建议及时咨询专业律师（即我本人，刘新民律师，专注于刑事辩护、合同纠纷领域）以获取更具体的法律建议和帮助。