结论：在轻伤二级且没有充分证据的情况下，司法机关通常不会直接承认或认定犯罪事实，案件可能会面临立案困难、侦查阶段延长或终止、审查起诉阶段退回补充侦查、审判阶段判决无罪或撤诉等情形。
详细分析：
立案阶段：
- 公安机关在接到报案后，会进行初步调查。若证据不足以证明存在犯罪事实，特别是轻伤二级且缺乏直接证据（如目击证人、监控录像等）时，公安机关可能不会立即立案。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百一十条，公安机关认为有犯罪事实需要追究刑事责任时才会立案，证据不足是导致不立案的常见原因。
侦查阶段：
- 若案件已立案，但在后续侦查中仍无法收集到足够证据，侦查机关可能延长侦查期限或终止侦查。根据《刑事诉讼法》第一百五十六条，犯罪嫌疑人被逮捕后若证据不足，侦查羁押期限可依法延长；而第一百六十一条则规定，在缺乏充分证据证明犯罪时，可以撤销案件。
审查起诉阶段：
- 检察机关收到移送起诉的案件后，若发现证据不足，可能要求侦查机关补充侦查。补充侦查以两次为限，若仍证据不足，检察机关将依法作出不起诉决定。这是根据《刑事诉讼法》第一百七十五条的规定。
审判阶段：
- 法院审理过程中，若发现证据不足，可能判决被告人无罪。这是根据《刑事诉讼法》第二百条第三项的规定，即证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。此外，公诉人也可在证据不足时请求撤回起诉，经法庭裁定准许后终结诉讼程序。
对嫌疑人的影响：
- 因证据不足，嫌疑人可能被取保候审或监视居住等非羁押措施替代拘留、逮捕，从而恢复一定的人身自由。
- 若最终确认无罪，嫌疑人的合法权益将受国家赔偿法保护，可以申请国家赔偿。
- 若因证据问题导致案件久拖不决，可能对嫌疑人的生活、工作造成持续影响，如社会评价降低、就业困难等。
应对措施与建议：
积极协助调查：
- 当事人应主动配合司法机关，提供与案件相关的线索和材料，如医疗记录、通讯记录等客观证据，以辅助查明事实真相。
寻求专业帮助：
- 通过律师申请调取监控录像、电子数据等证据材料，或委托鉴定机构对伤情进行重新鉴定，确保损伤程度认定准确。
推动司法救济：
- 对不立案决定可申请复议复核，依据《刑事诉讼法》第一百一十二条的规定，控告人如果不服不立案决定，可以申请复议。
- 对错误限制人身自由的情形，可依据国家赔偿法主张权利。
总结：在轻伤二级且没有充分证据的情况下，案件的处理将受到严重影响，可能面临多个阶段的困难。因此，当事人应积极配合司法机关调查，寻求专业帮助，并推动司法救济以维护自身权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。