结论：在轻伤二级案件中，若事实不清、证据不足，法院通常会根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，判决被告人无罪或作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。以下是对此问题的详细分析：
一、案件处理流程中的影响
立案阶段：
- 公安机关在接到报案后，会进行初步调查。若证据不足以证明存在犯罪事实，公安机关可能不会立即立案。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百一十条，公安机关认为有犯罪事实需要追究刑事责任时才会立案，证据不足可能导致公安机关作出不立案决定。
侦查阶段：
- 若已立案但后续侦查中仍无法收集到足够证据，侦查机关可能延长侦查期限或终止侦查。根据《刑事诉讼法》第一百五十六条，犯罪嫌疑人被逮捕后若证据不足，侦查羁押期限可依法延长；第一百六十一条规定，缺乏充分证据证明犯罪时可撤销案件。
审查起诉阶段：
- 检察机关收到移送起诉的案件后，若发现证据不足，可能要求侦查机关补充侦查。补充侦查以两次为限，若仍证据不足，检察机关将依法作出不起诉决定（《刑事诉讼法》第一百七十五条）。
审判阶段：
- 法院审理过程中发现证据不足的，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百条第三项，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。
二、对嫌疑人的具体影响
强制措施变更：
- 因证据不足，嫌疑人可能被取保候审或监视居住等非羁押措施替代拘留、逮捕。若最终确认无罪，嫌疑人将恢复人身自由并解除相关强制措施。
法律后果差异：
- 经法定程序确认无罪者，其合法权益受国家赔偿法保护。若因证据问题导致案件久拖不决，可能对嫌疑人的生活、工作造成持续影响。
三、应对措施与建议
积极协助调查：
- 当事人应主动配合司法机关，提供与案件相关的线索和材料，如医疗记录、通讯记录等客观证据，辅助查明事实真相。
寻求专业帮助：
- 通过律师申请调取监控录像、电子数据等证据材料，或委托鉴定机构对伤情进行重新鉴定，确保损伤程度认定准确。
推动司法救济：
- 对不立案决定可申请复议复核（《刑事诉讼法》第一百一十二条）。对错误限制人身自由的情形，可依据国家赔偿法主张权利。
四、特殊情况说明
- 若在审判阶段，公诉人因证据不足请求撤回起诉，并经法庭裁定准许，诉讼程序将终结，被告人不会被定罪。
五、法律依据
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百一十条、第一百五十六条、第一百六十一条、第一百七十五条、第二百条等相关条款，为处理轻伤二级案件中证据不足的情况提供了明确的法律依据。
总结与建议：在轻伤二级案件中，若事实不清、证据不足，法院通常会判决被告人无罪。作为当事人，应积极配合司法机关的调查工作，提供相关证据和线索，同时寻求专业律师的帮助，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。