结论前置：针对您描述的情况，即自己签完字的申请留有存根，但在仲裁时公司给加上了别的文字，您可以采取以下措施来维护自己的权益。

一、法律背景与原则

在劳动仲裁或任何法律程序中，证据的真实性和完整性是至关重要的。您手中的留存申请，作为原始证据，具有较高的证明力。如果公司擅自添加了文字，这可能构成对证据的篡改，是违法的行为，且该篡改后的证据可能不会被仲裁机构或法院采纳。

二、具体应对措施

1. 核对与比对证据：

   • 首先，您需要仔细核对您手中的留存申请与公司提交的申请之间的差异。
   • 确认哪些部分是被公司添加的，并做好标记或记录。

2. 提出异议并说明情况：

   • 在仲裁过程中，当公司提交其版本的申请时，您应立即提出异议，指出该申请与您手中的留存申请存在不一致之处。
   • 详细说明哪些部分是被公司添加的，并解释这些添加内容并非您的真实意思表示。

3. 提供留存申请作为证据：

   • 将您手中的留存申请作为证据提交给仲裁机构，以证明您的真实意思表示和申请内容。
   • 如果可能，您还可以提供其他相关证据，如与申请相关的沟通记录、邮件等，以进一步支持您的主张。

4. 申请鉴定或专家意见：

   • 如果仲裁机构或公司对您的留存申请的真实性或完整性存在疑问，您可以申请对申请进行鉴定，以确认其是否被篡改。
   • 或者，您可以寻求专家意见，如文件鉴定专家，来出具关于申请真实性的专业意见。

5. 强调法律后果：

   • 在仲裁过程中，您可以强调公司篡改证据的法律后果，包括可能面临的法律责任和仲裁机构或法院对公司的不利评价。

三、可能的法律后果

• 如果公司被证实篡改了证据，仲裁机构或法院可能会对其提交的证据不予采纳，甚至可能对公司进行处罚。
• 同时，公司的行为也可能损害其信誉和形象，在未来的劳动纠纷或法律程序中处于不利地位。

四、建议与提醒

• 在未来的劳动纠纷或法律程序中，建议您妥善保管所有相关证据，包括书面申请、沟通记录、邮件等，以备不时之需。
• 如果遇到类似情况，不要慌张，及时咨询专业律师（即我，周静律师，专注于劳动纠纷领域），以便更好地维护自己的权益。

五、进一步行动

• 如果您需要进一步的法律帮助或咨询，请随时向我提问。我可以根据您的具体情况，提供更详细和个性化的法律建议。