在土地转让合同未明确约定税款承担方的情况下，可按以下思路处理：
- 依据法律规定确定纳税义务人
根据《中华人民共和国契税法》第一条、第二条，以及《中华人民共和国土地增值税暂行条例》第二条等规定，土地转让环节的契税由承受方缴纳，土地增值税由转让方缴纳。法定纳税义务人不会因合同未约定而改变，例如：
- 若转让方未缴纳土地增值税，税务机关仍会向其追缴，并可能加收滞纳金或罚款；
- 若承受方未缴纳契税，税务机关会直接要求其补缴。
- 合同未约定的风险分配原则
若双方希望突破法定纳税义务人规则，需通过合同明确约定税款承担方。未约定时，可能面临以下风险：
- 实际承担方可能主张违约或不当得利：例如，转让方若实际承担了本应由承受方缴纳的契税，可能以“合同未约定”为由要求承受方返还；
- 税务机关追缴不受合同影响：税务机关仅依据税法确定纳税义务人，合同约定仅约束双方内部责任分配，不影响税务机关向法定纳税人追缴税款。
- 实务建议
- 补充约定：双方可签订补充协议，明确税款承担方（如约定“所有税费由承受方承担”），并注明“本约定不影响税务机关向法定纳税人追缴税款的权利”；
- 留存证据：若一方实际承担了对方应缴税款，需留存付款凭证、沟通记录等证据，以备后续主张权利；
- 税务合规：无论合同如何约定，法定纳税义务人需确保按时申报缴纳税款，避免滞纳金或行政处罚。
总结：合同未约定税款承担方时，法定纳税义务人仍需依法缴税，但双方可通过补充协议明确内部责任分配。若发生争议，需结合合同条款、交易习惯及证据综合判断责任归属。如有具体案例或细节需要分析，可进一步向我咨询。