在施工合同纠纷中，如税款承担未在合同中约定，应由双方协商签订补充协议，协商不成则依据税法规定由法定纳税义务人承担。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 施工合同税款约定的缺失

• 在建设工程施工合同中，如双方未对税款承担进行明确约定，根据《中华人民共和国民法典》第五百一十条，合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。

二. 税款承担的原则

• 若双方无法就税款承担达成补充协议，则应依据税法规定确定税款的承担者。在税法上，通常规定了各项税费的纳税义务人，如增值税、所得税等均有明确的纳税主体。
• 以增值税为例，根据《中华人民共和国增值税暂行条例》，出卖人（即提供货物或应税劳务的一方）通常是增值税的法定纳税主体，应依法承担纳税义务。

三. 实际案例的参考

• 在实际案例中，如华某公司与某乙公司的混凝土购买合同纠纷中，尽管合同备注了“单价为不含税价”，但并未明确税费由谁承担。法院最终判决由法定的纳税义务人（即出卖人华某公司）承担税费。

综上所述，在施工合同纠纷中，如税款承担未约定，双方应首先尝试协商签订补充协议。协商不成时，应遵循税法规定，由法定的纳税义务人承担税费。这一原则既符合民法典的合同补充规定，也体现了税法关于纳税义务人的明确规定。为避免类似纠纷，建议在签订合同时即明确税款的承担方式。如有进一步需要，您可以继续咨询我。