您有权基于合同约定要求对方承担违约责任，具体可通过协商、诉讼或仲裁等方式主张权利。以下是详细分析：

1. 合同依据与违约认定
   根据《民法典》第509条，当事人应按约定全面履行义务。合同明确约定“水电路三通”属于卖方/出租方的交付标准，若商铺水路实际不通，即使通过竣工验收，仍构成根本违约。竣工验收仅能证明工程符合行政规范，但无法对抗双方民事合同中的特别约定。

2. 权利主张路径

   • 协商解决：优先通过书面函件要求对方限期整改（如接通水路），并保留催告记录（如EMS邮寄凭证）。
     
   • 诉讼/仲裁：若协商无果，可依据合同争议解决条款向法院起诉或申请仲裁，主张：
     
     • 继续履行：要求对方完成水路接通义务；
       
     • 赔偿损失：包括因水路不通导致的经营损失（如租金差价、停业损失）、维修费用等；
       
     • 解除合同：若水路不通导致合同目的无法实现（如商铺无法正常使用），可依据《民法典》第563条主张解除合同并要求赔偿。

3. 关键证据收集

   • 合同文本：证明双方对“水电路三通”的明确约定；
     
   • 验收记录：若竣工验收报告未记载水路问题，可申请法院委托鉴定机构对水路现状进行司法鉴定；
     
   • 损失凭证：如维修发票、经营流水、租金支付记录等，证明实际损失金额。

4. 注意事项

   • 时效性：诉讼时效为3年，自知道权利受损之日起计算；
     
   • 合同条款：检查合同是否约定“验收合格视为交付完成”等免责条款，若有需结合具体表述分析其效力；
     
   • 实际使用：若您已实际使用商铺，可能被对方主张“默认接受交付条件”，需通过证据（如多次报修记录）反驳。

建议行动步骤：

1. 立即向对方发送书面《履约催告函》，明确要求限期整改；
   
2. 同步收集证据，必要时委托公证处对水路现状进行证据保全；
   
3. 若对方拒不履行，尽快委托律师起草起诉状或仲裁申请书，避免损失扩大。
   

如有进一步细节（如合同具体条款、验收过程等），可随时补充说明，我会为您定制更精准的维权方案。