针对您提出的“建筑工程合同未能通过验收，如何主张工程款支付”的问题，这是一个涉及合同法和建设工程法规的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、分析未验收原因及合同约定
首先，您需要明确建筑工程未能通过验收的具体原因。这可能是由于工程质量问题、发包人原因（如不配合提供必要资料）或其他因素导致的。同时，仔细审查合同中关于验收和付款的条款，了解合同对未验收情况下工程款支付的具体规定。
二、根据不同情况主张工程款支付
工程经竣工验收合格但未完成完整验收流程：
- 如果工程实际上已经达到了竣工验收的标准，只是由于某些程序上的原因（如资料不全、流程未走完）而未能完成完整验收流程，那么您有权参照合同关于工程价款的约定要求支付工程款。这体现了对承包人劳动成果的认可。
发包人未经竣工验收擅自使用工程：
- 如果发包人在工程未经验收的情况下擅自使用，这种行为通常被视为对工程质量的认可。在这种情况下，您同样可以主张工程款支付。
工程因发包人原因无法验收：
- 如果工程未能通过验收是由于发包人的原因（如不配合提供必要资料、恶意拖延验收等），而您已经完成了施工且达到了合同约定的标准，那么您具备要求支付工程款的权利基础。
工程质量明显不合格或合同明确约定需验收合格才支付工程款：
- 如果工程质量明显不合格，或者合同明确约定需验收合格才支付工程款，且不满足其他法定支付情形，那么您要求支付工程款的主张可能难以得到支持。在这种情况下，您需要先对工程进行整改，达到验收标准后再主张工程款支付。
三、采取法律措施维护权益
如果与发包人协商无果，您可以考虑采取以下法律措施来维护自己的权益：
收集证据：
- 收集能证明双方存在工程承包合同关系、已完成工程且质量合格（或已整改至合格）、工程款数额等相关证据，如合同文本、工程验收报告（如有）、结算单、往来函件等。
申请支付令：
- 如果欠款事实清楚、债权债务关系明确合法，您可以依督促程序向法院申请支付令。欠款方在规定期限内未提出异议的，支付令即生效。
提起诉讼：
- 向有管辖权的法院提交诉状及证据，通过诉讼解决纠纷。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明工程已经完成且符合要求，对方有义务履行付款。
申请司法鉴定：
- 如果需要，您可以申请法院进行司法鉴定，以明确工程的质量和价值，为诉讼提供强有力的支持。
四、注意事项
- 在整个过程中，保持与发包人的沟通，尽量通过协商解决问题。
- 如果采取法律措施，务必确保自己的行为合法合规，避免因不当行为而损害自己的权益。
- 咨询专业律师的意见，以确保自己的主张得到充分的法律支持。
综上所述，建筑工程合同未能通过验收时，如何主张工程款支付需要根据具体情况和合同约定来判断。在采取任何行动之前，建议您先咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到最大程度的保护。