针对您提出的“签了就业协议但体检不合格怎么办”的问题，这确实是一个涉及就业权益和流程的重要问题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，体检是就业流程中的一个重要环节，它旨在确保应聘者具备从事特定岗位所需的身体条件。当您已经签订了就业协议，但体检结果不合格时，处理方式会因具体情况和招聘单位的规定而有所不同。
一、了解体检不合格的具体原因
查看体检报告：首先，您需要仔细查看体检报告，了解不合格的具体项目和原因。这有助于您判断不合格是否由于可治愈或可改善的疾病或状况引起。
咨询医生：如有必要，您可以咨询专业医生，了解不合格项目对从事特定岗位的影响，以及是否有治疗或改善的可能性。
二、与招聘单位沟通
及时告知：一旦得知体检不合格，您应尽快与招聘单位的人力资源部门或相关负责人取得联系，告知他们体检结果，并询问下一步的处理方式。
了解政策：询问招聘单位是否有关于体检不合格的补救措施或特殊政策。例如，有些单位可能允许您在一定时间内进行复检，或者提供治疗建议并允许您在治愈后重新申请。
三、考虑复检或治疗
复检申请：如果招聘单位允许复检，您应按照要求提出申请，并在规定时间内完成复检。复检时，确保选择正规、有资质的医疗机构进行。
积极治疗：如果体检不合格是由于某种疾病或状况引起，且该疾病或状况是可治愈或可改善的，您应积极进行治疗，并在治愈后向招聘单位提供相关医疗证明。
四、了解法律权益
就业歧视：根据相关法律法规，用人单位在招聘过程中不得因应聘者的身体状况（除非该身体状况直接影响其从事特定岗位的能力）而歧视或拒绝录用。如果您认为体检不合格的原因涉及就业歧视，您可以向当地劳动监察部门或相关机构投诉。
合同条款：仔细审查您与招聘单位签订的就业协议，了解其中关于体检不合格的处理条款。如果协议中有明确规定，您应按照协议执行；如果没有规定或规定不明确，您可以与招聘单位协商解决。
五、备选方案
寻找其他机会：如果经过复检或治疗后仍然无法满足招聘单位的体检要求，或者招聘单位坚持拒绝录用，您可以考虑寻找其他就业机会。
提升自我：利用这段时间提升自己的专业技能和综合素质，为未来的就业做好更充分的准备。
六、案例参考
以您提供的案例为例，如果体检不合格是因为乙肝病毒携带（且该岗位不属于禁止乙肝病原携带者从事的工作），那么招聘单位的行为可能涉嫌就业歧视。在这种情况下，您可以向当地劳动监察部门投诉，并寻求法律援助或支持起诉来维护自己的平等就业权。
总之，面对签了就业协议但体检不合格的情况，您应保持冷静、积极沟通、了解法律权益，并根据实际情况采取合适的措施。希望这些建议能对您有所帮助。