结论：单位要求新人入职三天不干了需提前三天申请，否则直接走就扣工资的做法，一般不合法。以下从不同角度进行分析：
法律背景与规定
试用期离职规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。这意味着，劳动者在试用期内享有相对自由的离职权利，只需提前三日通知用人单位即可，无需用人单位同意。
工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，用人单位无权因劳动者未提前通知离职而克扣其工资。
具体分析
单位要求提前三天申请离职的合法性：
- 单位要求劳动者在试用期内提前三天申请离职，这一要求本身并不违法，因为《劳动合同法》确实规定了劳动者在试用期内需提前三日通知用人单位方可解除劳动合同。然而，这一要求并不构成单位扣工资的理由。
单位扣工资的违法性：
- 如前所述，根据《劳动法》的规定，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。因此，即使劳动者未提前三日通知用人单位而直接离职，单位也无权因此扣发其工资。单位若以此为由扣工资，将构成违法行为。
劳动者的应对措施：
- 若单位因劳动者未提前通知离职而扣发工资，劳动者可以首先与单位进行协商，要求单位补发工资。
- 若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
可能的法律后果
对单位：
- 若单位因劳动者未提前通知离职而扣发工资，将可能面临劳动监察部门的处罚，包括但不限于罚款、责令改正等。
- 同时，单位还可能因违法行为而承担民事赔偿责任，即向劳动者支付被扣发的工资及可能的赔偿金。
对劳动者：
- 劳动者若因单位扣发工资而申请劳动仲裁或提起诉讼，将有可能获得被扣发的工资及相应的赔偿。
- 但需注意，劳动者在离职时也应尽量遵守法律法规和单位规章制度，提前通知用人单位，以避免不必要的纠纷和损失。
建议：作为劳动者，在入职时应仔细了解单位的规章制度和劳动合同条款，明确自己的权利和义务。在离职时，应尽量提前通知用人单位，并办理好相关离职手续。若遇到单位扣发工资等违法行为，应及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。