员工拒绝加班被罚款是不合理且违法的，以下是对此问题的详细分析：
一、加班的法律规定
根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位由于生产经营需要，确实可以安排劳动者延长工作时间（即加班），但这一安排必须满足两个关键条件：一是与工会协商，二是与劳动者本人协商。这意味着，劳动者有权拒绝不合理的加班要求，加班并非强制性的，而是需要双方协商一致。
二、罚款的合法性分析
罚款的行政处罚性质：罚款属于行政处罚范畴，通常由法律、法规授权的行政机关实施。企业并非行政机关，不具备实施行政处罚的权力。
企业罚款的违法性：企业通过内部规章设立罚款条款，不仅违反了《中华人民共和国劳动合同法》中关于劳动报酬保护的规定，也超越了《中华人民共和国行政处罚法》赋予企业的权限范围。因此，企业对拒绝加班的劳动者进行罚款，属于违法行为。
三、劳动者的权益保护
休息休假权：劳动者享有休息休假的权利，这是其基本权益之一。拒绝不合理的加班要求，是劳动者依法行使自己的权利。
劳动报酬权：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十一条，用人单位安排加班的，应当按照国家有关规定向劳动者支付加班费。这体现了法律对劳动者劳动报酬权的保护。
四、维权途径与建议
若劳动者遭遇因拒绝加班被罚款的情况，可以采取以下措施来维护自身合法权益：
与用人单位协商：首先尝试与用人单位进行沟通，说明自己的立场和法律依据，争取达成和解。
向劳动监察部门投诉：若协商不成，可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
通过劳动仲裁或诉讼：在必要时，可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自身合法权益。建议劳动者在遭遇此类问题时，保留好相关证据（如罚款通知、加班记录等），以便在维权过程中提供有力支持。
总结
综上所述，员工拒绝加班被罚款是明显违法的。用人单位应严格遵守劳动法律法规，尊重劳动者的合法权益，不得强迫或变相强迫劳动者加班，更不得以罚款等违法手段来迫使员工加班。同时，劳动者也应了解自己的权利和义务，勇于维护自身的合法权益。在遇到类似问题时，可通过合法途径寻求帮助和解决方案。