工资代扣停车费是否合法，需分情况讨论：
若员工同意且符合公司规定：
- 合法性分析：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因员工本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从员工本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。若员工同意公司从其工资中代扣停车费，且该费用不属于因员工原因给公司造成的经济损失，但双方在劳动合同或公司规章制度中有明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种代扣行为在双方协商一致的情况下，可以视为合法。但需注意，这种合法性是基于双方的约定，而非法律法规的直接规定。
- 建议：尽管双方可以约定代扣，但公司应确保该约定不违反法律法规的强制性规定，且应明确告知员工代扣的具体金额、方式及期限等，以保障员工的知情权。
若员工不同意或公司无明确规定：
- 合法性分析：若员工不同意公司从其工资中代扣停车费，或公司规章制度中未明确规定此类代扣行为，那么公司擅自代扣停车费则可能构成违法。因为工资是员工劳动所得，公司无权擅自扣除，除非法律法规有明确规定或双方有明确约定。
- 法律后果：若公司擅自代扣停车费，员工有权向公司提出异议，并要求公司补发被扣除的工资。若公司拒绝补发，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。
额外提醒：
- 公司规章制度的重要性：公司应建立健全的规章制度，明确工资支付、扣除等事项的具体规定，以避免因规定不明确而引发的劳动争议。
- 员工权益的保护：员工在面对公司擅自代扣工资等行为时，应勇敢维护自己的合法权益，及时与公司沟通协商，或寻求法律途径解决。
总结：工资代扣停车费是否合法，取决于员工是否同意以及公司规章制度是否有明确规定。在双方协商一致且不违反法律法规强制性规定的情况下，可以视为合法；否则，则可能构成违法。若您对此类问题有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。