在未针对一审判决提起上诉的情况下，申请再审并不必然存在程序瑕疵，但需满足法定条件。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律程序的基本框架

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人对一审判决不服的，有权在法定期限内提起上诉，这是二审程序的启动方式。然而，如果当事人未在法定期限内提起上诉，一审判决将发生法律效力。但这并不意味着当事人就完全丧失了救济途径，因为法律还规定了再审程序作为对已经发生法律效力的判决、裁定的特殊救济方式。

二、再审程序的启动条件

再审程序的启动需要满足一定的法定条件，这些条件主要包括：

1. 实体条件：即原判决、裁定存在法律规定的再审事由，如证据不足、适用法律错误、程序违法等。

2. 程序条件：

   • 主体资格：申请再审的主体必须是原判决、裁定的当事人或者其法定代理人、近亲属。
   • 时限要求：当事人申请再审的，应当在判决、裁定发生法律效力后六个月内提出。但存在特定情形（如发现新的证据、原判决裁定依据的法律文书被撤销或变更等）的，可以自知道或者应当知道之日起六个月内提出。
   • 提交材料：当事人申请再审的，应当提交再审申请书等材料，明确再审请求、事实和理由。

三、未上诉对再审申请的影响

未针对一审判决提起上诉，并不直接导致再审申请存在程序瑕疵。关键在于再审申请是否满足上述的实体条件和程序条件。如果当事人未上诉是因为对一审判决认可，或者因疏忽、经济困难等原因未提起上诉，但后来发现一审判决存在错误，仍然有权在法定期限内申请再审。

四、实际操作中的注意事项

1. 及时申请：由于再审申请有时限要求，当事人应在发现一审判决存在错误后尽快申请再审，以免错过申请时机。

2. 充分准备：在申请再审时，当事人应充分准备相关证据和材料，以证明一审判决存在错误，并明确再审请求和事实理由。

3. 寻求专业帮助：再审程序涉及复杂的法律问题和程序要求，当事人可以寻求专业律师的帮助，以提高再审申请的成功率。

五、法律后果

如果当事人的再审申请被法院受理并裁定再审，那么原判决、裁定将中止执行，案件将进入再审程序进行重新审理。如果再审法院认为原判决、裁定确有错误，将依法改判或者撤销原判决、裁定，并作出新的判决、裁定。

总结来说，未针对一审判决提起上诉并不直接导致再审申请存在程序瑕疵。当事人只要满足再审程序的启动条件，就有权在法定期限内申请再审。如果您在再审申请过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。