对于劳动合同的无效或者部分无效有争议的，确认部门主要包括劳动争议仲裁机构和人民法院。以下是对这一问题的详细分析：

一、确认部门及程序

1. 劳动争议仲裁机构

   • 定义与组成：劳动争议仲裁委员会是依法设立的专门处理劳动争议的机构，由劳动行政部门代表、工会代表和企业方面代表共同组成，具有专业性和权威性。
   • 申请与受理：当劳动者与用人单位就劳动合同效力产生争议时，任何一方均可向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提出申请。仲裁委员会将依据相关法律法规，对申请进行审查并决定是否受理。
   • 审查与裁决：受理后，仲裁委员会将对劳动合同的订立过程、合同条款内容等进行全面审查，并依法作出劳动合同是否无效或部分无效的裁决。

2. 人民法院

   • 定义与职责：人民法院是国家的司法机关，具有对劳动争议案件进行最终裁判的权力。
   • 诉讼提起：若当事人对劳动争议仲裁机构的裁决不服，可在规定期限内向人民法院提起诉讼。在某些地区，当事人也可选择直接跳过仲裁程序，直接向人民法院提起民事诉讼（但通常建议先仲裁后诉讼，以遵循劳动争议处理的基本程序）。
   • 审理与判决：人民法院将按照民事诉讼程序对案件进行全面审理，包括听取双方当事人的陈述、审查证据等，并依法作出判决，确定劳动合同的效力状态。此判决具有终局性。

二、劳动合同无效或部分无效的情形

• 全部无效：劳动合同存在以下情形之一的，可能被认定为全部无效：以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的；用人单位免除自己的法定责任、排除劳动者权利的；违反法律、行政法规强制性规定的等。
• 部分无效：劳动合同部分内容违法或违反公共利益，但不影响合同其余部分效力的，其余部分仍然有效。例如，合同中约定的加班费计算方式违反法律规定，但不影响合同中关于工作时间、工资支付等其他条款的效力。

三、法律后果与注意事项

• 法律后果：一旦劳动合同被确认为无效或部分无效，该合同自订立时起即不具有法律效力。双方基于该合同所建立的权利义务关系将不复存在或部分不复存在。对于已履行的部分，如劳动者已付出劳动的，用人单位应当向劳动者支付劳动报酬。
• 注意事项：
  • 证据支持：劳动合同无效的确认需要有充分的证据支持。当事人在申请仲裁或提起诉讼时，应提供足够的证据来证明劳动合同的无效性或部分无效性。
  • 程序遵循：当事人应遵循法定程序处理劳动合同无效争议，先向劳动争议仲裁机构申请仲裁，若对仲裁结果不满再向人民法院提起诉讼。

总结与建议：在处理劳动合同无效或部分无效争议时，当事人应首先明确争议内容，收集相关证据，然后按照法定程序向劳动争议仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼。在整个过程中，建议当事人咨询专业律师（即我本人，巫阳华律师，专注于合同纠纷、离婚财产纠纷领域），以确保自身权益得到有效维护。