让顾客自助扫码开发票是合法的，但需满足一定条件并遵守相关法律规定。以下从不同角度为你详细分析：

1. 从发票开具的合法性角度
   根据《中华人民共和国发票管理办法》及其实施细则，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。只要商家按照实际交易情况，通过自助扫码的方式准确、完整地开具了发票，且发票内容与实际交易相符，这种开具方式就是合法的。例如，顾客在餐厅消费后，通过扫描商家提供的二维码，自行填写消费金额、商品或服务名称等信息，商家后台审核无误后开具发票，这种方式是可行的。

2. 从消费者权益保护角度
   商家提供自助扫码开发票的服务，应当确保消费者能够方便、快捷地获取发票。如果商家设置的自助扫码流程过于复杂，或者存在技术故障导致消费者无法正常开具发票，可能侵犯消费者的合法权益。根据《消费者权益保护法》，消费者有权要求经营者提供商品或者服务的发票等购货凭证或者服务单据。因此，商家有义务保障自助扫码开发票系统的正常运行，并在消费者遇到问题时及时提供帮助。

3. 从税务合规角度
   商家通过自助扫码开发票，必须确保所有开具的发票都纳入税务监管系统，并按照规定进行纳税申报。如果商家利用自助扫码的方式隐瞒收入、虚开发票或者进行其他税务违法行为，将面临税务机关的处罚。例如，商家可能通过篡改自助扫码系统中的数据，少报收入以减少税款缴纳，这种行为是违法的，一旦被发现将受到严厉的处罚。

建议：

• 商家在提供自助扫码开发票服务时，应当确保系统的稳定性和易用性，避免因技术问题给消费者带来不便。
  
• 商家应当建立健全的发票管理制度，确保所有开具的发票都真实、合法、有效，并按照规定进行保存和归档。
  
• 消费者在遇到自助扫码开发票问题时，应当及时与商家沟通，要求商家提供必要的帮助和支持。如果商家拒绝提供发票或者存在其他违法行为，消费者可以向税务机关或者消费者协会投诉举报。

如果你在发票开具、税务合规或者消费者权益保护方面还有其他疑问，欢迎随时向我咨询。