结论：在您描述的情况下，劳动关系的认定需要综合考虑多个因素，包括但不限于工作安排、工资发放、社保缴纳以及实际管理情况等。一般来说，若总公司将您调入分公司，但未与分公司签订新的劳动合同，且工资仍由原公司（总公司）发放，这并不意味着您与分公司的劳动关系不存在，而是需要具体分析实际情况来确定。
详细分析：
工作安排与实际管理：
- 如果您被总公司调入分公司后，实际的工作安排、日常管理以及工作任务均由分公司负责，那么这通常表明您与分公司之间存在实际的劳动关系。
- 即便工资由总公司发放，这也不足以否定您与分公司之间的劳动关系，因为工资发放只是劳动关系中的一个方面，不是决定性因素。
劳动合同与社保缴纳：
- 劳动合同是认定劳动关系的重要依据，但并非唯一依据。在没有签订新劳动合同的情况下，如果分公司实际承担了对您的工作管理责任，且您为分公司提供了劳动，那么劳动关系仍然可能成立。
- 社保缴纳情况也是认定劳动关系的一个重要参考。如果分公司为您缴纳了社保，那么这进一步支持了您与分公司之间存在劳动关系的观点。
法律后果与建议：
- 如果您与分公司之间存在实际的劳动关系，但未签订劳动合同，那么分公司可能面临支付双倍工资、补缴社保等法律责任。
- 对于您个人而言，如果希望明确劳动关系，可以与分公司协商签订劳动合同，或者向劳动仲裁机构申请仲裁，要求确认劳动关系。
- 在此过程中，建议您收集并保留好与分公司相关的工作证据，如工作证、工作邮件、考勤记录等，以便在需要时证明您与分公司之间的劳动关系。
特殊情况考虑：
- 如果总公司与分公司之间有明确的内部调派协议，且该协议中明确规定了您的劳动关系归属、工资发放等事项，那么劳动关系的认定可能需要参考该协议的具体内容。
- 另外，如果总公司与分公司之间存在关联交易或财务混同等情况，这也可能影响劳动关系的认定，需要具体分析。
后续行动建议：
- 首先，与分公司沟通，了解其对您劳动关系的看法和态度，尝试协商签订劳动合同或明确劳动关系。
- 如果沟通无果，您可以向当地的劳动仲裁机构申请仲裁，要求确认您与分公司之间的劳动关系。
- 在整个过程中，建议您咨询专业律师（即我本人，李悦律师，专注于经济纠纷、劳动纠纷领域）的意见，以便更好地维护自己的合法权益。
希望以上分析能够对您有所帮助。如果您有任何进一步的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。