核心结论：实习期非正常离职工资的扣除需分情况讨论，具体如下：

1. 若劳动合同或实习协议中有明确约定
   根据《劳动合同法》第二十二条、二十三条，若协议中明确约定了非正常离职（如未提前通知、违反保密义务等）的违约金或赔偿条款，且该条款不违反法律强制性规定（如违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用），则用人单位可按约定扣除相应工资。但需注意：

   • 扣除金额不得超过劳动者当月工资的20%；
     
   • 扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准；
     
   • 用人单位需承担“非正常离职造成实际损失”的举证责任（如因离职导致项目延误的直接经济损失）。

2. 若协议无约定或约定违法

   • 未提前通知离职：若劳动者未提前30日（试用期为3日）通知用人单位即离职，用人单位不得直接扣除工资，但可要求劳动者赔偿因未提前通知导致的直接经济损失（如紧急招聘成本、临时替代人员工资等），且需提供损失证据。
     
   • 违法解除劳动关系：若劳动者以暴力、威胁或非法限制人身自由等方式离职，或违反竞业限制、保密义务等，用人单位可依据《劳动合同法》第九十条要求赔偿，但同样需证明损失与离职行为的因果关系。
     
   • 无合法理由扣工资：若用人单位无法证明损失，或扣除行为违反《工资支付暂行规定》第十六条（如扣除后工资低于最低标准），则属于违法行为，劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

3. 特殊情形：实习生与用人单位的“实习协议”
   若双方签订的是实习协议而非劳动合同（常见于在校学生实习），则适用《民法典》合同编而非劳动法。此时：

   • 若协议约定“非正常离职需支付违约金”，需符合《民法典》第五百八十四条（违约金不得超过实际损失的30%）；
     
   • 若无约定，用人单位仅能主张实际损失赔偿，且需举证（如因离职导致客户流失的直接经济损失）。

建议：

• 劳动者：离职前尽量与用人单位协商，保留书面沟通记录（如邮件、微信）；若被违法扣工资，可收集工资条、考勤记录、离职证明等证据，向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。
  
• 用人单位：在协议中明确离职流程及违约责任，保留劳动者违约的证据（如未提前通知的书面记录、损失计算依据），避免随意扣工资引发纠纷。
  

如有具体协议条款或纠纷细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您分析。