您好，针对您提出的“单位不配合办理建造师证是否违法”的问题，我可以为您详细解答。
首先，单位不配合办理建造师证的相关手续，如注销注册或转注册等，并不直接等同于违法，但这种行为可能违反了相关的行业管理规定和劳动合同约定，从而给您带来不必要的麻烦和损失。
具体来说，根据《注册建造师执业管理办法》的相关规定，注册建造师在申请注销注册或转注册时，需要提供与原聘用企业解除劳动关系的有效证明材料。如果原聘用单位不配合出具这些证明材料，实际上已经妨碍了您正常行使自己的职业权利。
在这种情况下，我建议您采取以下措施来维护自己的权益：
与单位协商：首先尝试与单位进行友好协商，明确表达您的诉求和依据，看是否能够达成共识并解决问题。
向劳动仲裁部门或法院申诉：如果协商无果，您可以向当地的劳动仲裁部门或法院提出申诉，要求解除与单位的劳动关系，并获取相应的证明材料。这些部门将依法进行裁决，并出具具有法律效力的证明文件。
向相关部门申诉：在获取了解除劳动关系的证明材料后，如果单位仍然不配合办理建造师证的相关手续，您可以向当地的注册中心或相关管理部门提交申诉报告，并附上相关证明材料。这些部门将根据您的申诉情况进行调查处理，并可能要求单位配合办理相关手续。
寻求法律援助：在整个过程中，如果您感到自己的权益受到了严重侵害，也可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。
总的来说，虽然单位不配合办理建造师证的相关手续并不直接等同于违法，但这种行为确实违反了行业管理规定和劳动合同约定。您有权通过合法途径维护自己的权益，并要求单位配合办理相关手续。希望这些建议能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。