核心结论：加班到凌晨第二天上午没上班，加班费的计算需分情况讨论，主要取决于加班的性质（工作日加班、休息日加班还是法定节假日加班）以及公司的具体规章制度（是否合法合规）。以下是具体分析：

1. 工作日加班到凌晨，第二天上午未上班
   根据《劳动法》第四十四条，工作日加班应支付不低于工资150%的加班费。若加班到凌晨已超出正常工作时间（如8小时），超出部分属于工作日加班，公司应按150%支付加班费。

   • 关键点：第二天上午未上班是否影响加班费计算？
     若公司规章制度或劳动合同未明确规定“加班后需补班”，则第二天上午未上班不影响已加班时段的加班费计算。但若公司以“未补班”为由扣减加班费，可能涉嫌违法，员工可主张权利。

2. 休息日加班到凌晨，第二天上午未上班
   休息日加班且未安排补休的，公司应支付不低于工资200%的加班费。若加班到凌晨属于休息日加班，公司需按200%支付加班费，第二天上午未上班不影响已加班时段的费用计算。

   • 关键点：休息日加班后是否必须补班？
     根据《劳动法》，休息日加班可优先安排补休，若未补休则支付加班费。但公司无权强制要求员工在休息日加班后补班，除非劳动合同或规章制度中有明确约定（且约定需合法合理）。

3. 法定节假日加班到凌晨，第二天上午未上班
   法定节假日加班无论是否补休，公司均需支付不低于工资300%的加班费。若加班到凌晨属于法定节假日加班，公司必须按300%支付加班费，第二天上午未上班不影响费用计算。

   • 关键点：法定节假日加班的强制性
     法定节假日加班具有强制性，公司不得以“调休”替代加班费，且员工有权拒绝非必要的法定节假日加班安排。

4. 公司规章制度的影响
   若公司规章制度中规定“加班后需补班”或“加班费与出勤挂钩”，需审查该制度是否合法：

   • 制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）并公示；
     
   • 制度内容不得违反《劳动法》强制性规定（如低于法定加班费标准）。
     若制度违法，员工可主张按法定标准计算加班费。

建议行动：

1. 收集证据：保留加班记录（如考勤表、加班通知）、工资条等，证明加班事实及未足额支付加班费的情况；
   
2. 与公司协商：向公司人力资源部门提出异议，要求按法定标准支付加班费；
   
3. 申请劳动仲裁：若协商无果，可向当地劳动仲裁委员会申请仲裁，主张加班费及可能的经济补偿。

如有进一步疑问或需要具体操作指导，可直接向我咨询。