结论：劳动仲裁部门询问公司要工作六年之间的加班费时，提出为何第一年不主张的问题，这主要涉及到劳动仲裁的时效性规定以及员工主张加班费的具体情况。以下从几个方面进行详细分析：

1. 劳动仲裁的时效性：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这意味着，如果员工在第一年就知道或应当知道公司未支付加班费，那么理论上他应在一年内提出仲裁申请。
   • 然而，对于劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生的争议，劳动者申请仲裁不受上述一年仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。因此，如果员工在六年工作期间内一直未提出加班费主张，但在劳动关系终止后一年内提出，是符合时效性规定的。

2. 员工主张加班费的具体情况：

   • 员工可能因各种原因在第一年未主张加班费，如不了解自己的权益、担心影响工作关系、希望与公司协商解决等。这些原因并不影响员工后续在符合时效性规定的情况下提出加班费主张。
   • 如果员工在第一年未主张加班费，但后续有证据表明公司确实存在未支付加班费的行为，且该行为持续存在或员工在劳动关系终止后一年内提出主张，那么劳动仲裁部门仍会受理并审理该案件。

3. 公司应对策略：

   • 对于公司而言，面对劳动仲裁部门关于加班费的询问，应首先核实员工的工作记录、考勤记录以及加班费支付情况。
   • 如果公司确实存在未支付加班费的行为，应积极与员工协商解决，避免法律纠纷。如果公司认为员工的主张不成立或已超过时效性规定，则应在仲裁过程中提供相应证据进行抗辩。

4. 法律建议：

   • 对于员工而言，如果认为自己存在未被支付的加班费，应及时了解自己的权益并收集相关证据。在符合时效性规定的情况下，可以向劳动仲裁部门提出仲裁申请。
   • 对于公司而言，应建立健全的加班费支付制度，确保员工的加班费得到及时、足额的支付。同时，加强与员工的沟通，避免因加班费问题引发法律纠纷。

举例说明：假设员工A在公司工作了六年，期间存在加班情况但公司未支付加班费。在第六年工作结束后，员工A决定提出加班费主张。此时，虽然员工A在第一年未提出主张，但如果他能在劳动关系终止后一年内提出仲裁申请，并提供充分的证据证明公司存在未支付加班费的行为，那么劳动仲裁部门仍会受理并审理该案件。

进一步思考：在实际操作中，劳动仲裁部门会综合考虑各种因素来判定员工的主张是否成立以及公司是否应支付加班费。因此，无论是员工还是公司，都应充分了解相关法律法规并收集充分证据来支持自己的主张。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。