在员工旷离后申请劳动仲裁的情况下，单位应当根据仲裁请求和案件具体情况，准备并出具一系列相关文件以支持其主张或进行抗辩。以下是从不同角度对单位应出具文件的详细分析：
一、针对员工仲裁请求的抗辩文件
劳动合同及附件：
- 提供与员工签订的劳动合同及其附件，以证明双方之间的劳动关系、工作内容、工作地点、工作时间、薪酬待遇等关键条款。
- 若劳动合同中有关于旷工、离职、违约责任等条款，这些条款将作为单位抗辩的重要依据。
员工旷工证据：
- 收集并整理员工旷工的证据，如考勤记录、监控录像、同事证言等，以证明员工存在旷工行为。
- 若单位有明确的规章制度关于旷工的处理，也应一并提供，以证明单位对旷工行为的处理是合法合规的。
离职手续相关文件：
- 若员工未按照单位规定办理离职手续，单位应提供相关证据，如离职申请表、离职交接单等，以证明员工未履行离职程序。
- 若单位已就员工旷工行为发出过警告或处理决定，这些文件也应一并提供，以证明单位已尽到管理责任。
二、支持单位主张的其他文件
规章制度及公示证据：
- 提供单位的规章制度，特别是关于员工考勤、离职、违约责任等方面的规定。
- 提供规章制度已向员工公示或告知的证据，如员工签字确认的规章制度学习记录、单位内部公告等。
薪酬发放记录：
- 提供员工的薪酬发放记录，以证明单位已按照劳动合同约定支付了员工工资。
- 若员工存在旷工行为，单位可能需要根据规章制度扣除相应工资，此时应提供扣除工资的依据和计算方式。
其他相关证据：
- 根据案件具体情况，单位可能还需要提供其他相关证据，如员工工作表现评价、培训记录、奖惩记录等，以支持其主张或抗辩。
三、法律建议与注意事项
及时准备与提交文件：
- 单位应在收到劳动仲裁通知后，及时准备并提交相关文件，以确保仲裁程序的顺利进行。
- 提交的文件应真实、合法、有效，且能够充分支持单位的主张或抗辩。
注意文件保密性：
- 在准备和提交文件过程中，单位应注意保护员工的隐私和个人信息，避免泄露不必要的敏感信息。
寻求专业法律帮助：
- 若单位在准备文件或应对仲裁过程中遇到法律难题，应及时寻求专业律师的帮助，以确保单位的合法权益得到充分保障。
总结来说，在员工旷离后申请劳动仲裁的情况下，单位应根据仲裁请求和案件具体情况，准备并出具劳动合同及附件、员工旷工证据、离职手续相关文件、规章制度及公示证据、薪酬发放记录以及其他相关证据等文件以支持其主张或进行抗辩。同时，单位也应注意文件的及时准备与提交、保密性以及寻求专业法律帮助等事项。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。