请假又扣底薪又扣补贴是否合理，需根据具体情况、公司规定以及法律法规来综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、扣底薪的合理性分析
合法情形：
- 根据《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》，员工因私请假缺勤时，用人单位有权按照其请假的天数及日工资标准扣除相应的底薪。例如，月薪5000元的员工，在每月21.75个工作日的基础上，若请1天事假，则单位扣除约229.89元（5000÷21.75）底薪是合理的。
- 但需注意，对于法定带薪假，如年休假、婚假、产假等，用人单位不得扣除底薪。这些假期由《职工带薪年休假条例》及《劳动法》等相关法律明确规定，员工在这些假期期间应享受与正常工作期间相同的工资收入。
违法情形：
- 若用人单位在员工休法定带薪假时扣除底薪，则构成违法行为，员工有权要求用人单位补发工资，并可能因此获得相应的赔偿。
二、扣补贴的合理性分析
补贴通常属于员工工资的一部分，但具体是否应扣除需根据补贴的性质和公司规定来判断。
与出勤直接相关的补贴：
- 如果补贴是与出勤直接相关的，如交通补贴、餐补等，且公司规定中明确说明了请假会扣除相应补贴，那么这种扣除可能是合理的。但扣除的数额应与员工请假的天数和补贴的标准相符。
与出勤无直接关系的补贴：
- 如果补贴是与出勤无直接关系的，如岗位津贴、技能补贴等，那么用人单位在员工请假时扣除这些补贴可能是不合理的。因为这些补贴通常是对员工岗位或技能的认可，与是否出勤无直接关联。
公司规定不合法或不合理：
- 如果公司关于扣除补贴的规定不合法或不合理，如无论请假天数多少都一律全额扣除补贴，或没有明确的扣除标准而随意扣除，那么这种扣除行为也是违法的。
三、公司规定的合法性审查
- 公司关于请假扣薪和扣除补贴的规定应事先明确，并写入员工手册或劳动合同中。这些规定不得违反法律法规的强制性规定，否则将视为无效。
- 员工在入职时应仔细阅读并了解公司规定，以便在后续工作中对自己的权益有清晰的认知。如果公司规定存在模糊或不合理之处，员工有权向公司提出异议或寻求法律帮助。
四、维权途径
- 如果劳动者认为用人单位的扣薪和扣除补贴行为不合理，首先应与用人单位进行沟通协商，要求其说明扣薪和扣除补贴的依据。
- 若协商不成，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，劳动者应提供相关证据，如工资条、请假条、公司规定等，以证明自己的主张。
总结与建议：
请假又扣底薪又扣补贴是否合理，需结合具体情况、公司规定以及法律法规进行综合判断。作为劳动者，在面对不合理扣薪和扣除补贴时，应积极采取措施维护自己的合法权益。如果对此有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。