结论：请假既扣工资又扣本休假（如年假）的行为，在大多数情况下既不合理也不合法。具体是否合法，需根据请假的类型、公司规章制度以及相关法律法规进行综合判断。以下是对不同类型请假情况的详细分析：
年假请假：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十五条及《职工带薪年休假条例》第二条，职工连续工作一年以上的，享受带薪年休假。职工在年休假期间应享受与正常工作期间相同的工资收入。
- 分析：若职工请的是年假，且符合享受年假的条件，那么用人单位在职工休年假期间扣发工资是违法的。职工有权要求用人单位补发被扣的工资，并可以通过协商、投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径维护自己的合法权益。
事假请假：
- 公司规章制度：事假的工资扣除通常依据公司的规章制度。一些公司可能规定，事假期间不支付工资，或者按照一定比例扣除工资。
- 分析：如果公司规章制度明确规定了事假期间的工资扣除方式，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位按照规章制度扣除工资可能是合法的。但是，如果规章制度中未明确规定，或者规定违反了法律法规，那么用人单位扣除工资的行为就可能是违法的。
- 特殊情况：根据《职工带薪年休假条例》第四条，职工请事假累计20天以上且单位按照规定不扣工资的，职工将不享受当年的年休假。但这并不意味着用人单位可以在职工请事假时随意扣除工资或年假。
病假请假：
- 法律依据：病假期间的工资支付通常依据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》等相关法律法规。在医疗期内，用人单位应当按照规定支付职工病假工资或疾病救济费。
- 分析：若职工请的是病假，且符合享受病假工资的条件，那么用人单位在职工病假期间扣发工资是违法的。职工有权要求用人单位按照法律法规的规定支付病假工资。
综合建议：
- 了解公司规章制度：职工在请假前应了解公司的规章制度，特别是关于请假期间工资支付的规定。
- 与用人单位协商：如果职工认为用人单位扣除工资的行为违法或不合理，可以首先尝试与用人单位协商解决。
- 寻求法律援助：如果协商无果，职工可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁、提起诉讼等途径维护自己的合法权益。
总结：请假既扣工资又扣本休假的行为是否合法，需根据请假的类型、公司规章制度以及相关法律法规进行综合判断。职工在请假前应了解相关规定，并在必要时寻求法律援助以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。