结论：公司一个月固定两天休息，请假一天要把休息两天扣掉的做法，一般是不合理的。以下从不同角度为你详细分析：
从法律规定角度
根据我国《劳动法》及相关规定，劳动者享有休息休假的权利。用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日，并且对于法定节假日、年休假等法定休息休假时间也有明确规定。公司规定的每月固定两天休息，若这符合每周至少休息一日的基本要求（比如一个月按四周算，每周休息半天，但累计每月两天且不违反其他休息休假规定），本身是可以的。然而，当劳动者请假一天时，公司直接扣除原本固定的两天休息，这种做法缺乏法律依据。
劳动者请假是基于自身合理事由，如生病、处理个人事务等，请假期间用人单位可以根据规定扣除相应的工资（比如事假一般无薪，病假按照一定比例支付工资等），但不能随意剥夺劳动者原本就享有的休息休假权利。休息休假是劳动者的法定权益，不能因为一次请假就被全部剥夺。
从公司规章制度合理性角度
公司制定规章制度应当遵循合法、合理、公平的原则。如果公司规章制度中明确规定“请假一天扣除固定休息两天”，这样的规定明显不合理。合理的规章制度应该是在保障劳动者基本权益的前提下，对请假等事项进行规范。例如，可以规定请假按照实际请假天数扣除相应工资，而不是无端扣除休息时间。
而且，公司规章制度在制定过程中，应当经过民主程序（如与职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定等），并且要向劳动者公示或者告知。如果该规定没有经过这些合法程序，那么对劳动者也不具有约束力。
可能的法律后果
如果公司坚持这种不合理的做法，劳动者可以采取以下措施维护自己的合法权益：
建议：你可以先查看公司的规章制度中是否有关于请假和休息的相关规定，了解其具体内容和制定程序。如果认为公司的做法不合理，可以先与公司进行沟通协商。如果协商不成，再考虑通过向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或者需要进一步的帮助，随时都可以向我咨询。