请一天假扣除两天工资的做法，在大多数情况下是不合法的，它侵犯了劳动者的合法权益。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、法律依据与合法性分析
核心法规：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也强调，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
- 《工资支付暂行规定》第十五条进一步指出，用人单位不得克扣劳动者工资，除非存在法律规定的特定情形（如代扣代缴个人所得税、社会保险费用等）。
具体假期分析：
- 带薪假期：如法定节假日、年休假、婚假、丧假等，根据《劳动法》第五十一条，这些假期内，用人单位应正常支付工资，不得克扣。
- 事假：虽然法律未对事假工资扣除作出统一规定，但原则上是按实际未提供劳动的天数扣除工资，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。因此，请一天事假扣除两天工资的做法，若导致剩余工资低于最低工资标准，则属违法。
- 旷工：企业可依据自身规章制度处理旷工员工，但扣除后的剩余工资同样不得低于最低工资标准，且需遵循合理、合法、不违反公序良俗的原则。
二、不合法情况举例
- 假设某员工月工资为5000元，当地月最低工资标准为2000元。若该员工请1天事假，单位却扣了两天工资（即扣除1000元），导致当月剩余工资为4000元（虽高于最低工资标准，但若此做法成为常态或针对特定员工，可能构成不公平对待或违反内部规章制度），若扣除后工资低于最低工资标准（如扣除1500元后剩余3500元虽仍高于最低工资，但若扣除更多导致低于2000元），则肯定违法。
- 另一例子，员工旷工1天，公司若扣除其旷工当天工资及过多绩效奖金，导致当月工资低于最低工资标准，同样违法。
三、劳动者维权途径
面对“请一天假扣两天工资”的不合法做法，劳动者可采取以下措施维护自身权益：
- 与单位协商：首先尝试与单位沟通，要求按照法律规定支付工资。
- 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉，请求协助解决。
- 申请劳动仲裁：问题仍未解决时，可向当地劳动仲裁机构申请仲裁。仲裁生效后，单位若拒绝执行，劳动者可申请法院强制执行。
四、特殊情况说明
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了请假的工资扣除方式，且该规定不违反法律法规的强制性规定（如扣除比例合理、不导致工资低于最低工资标准等），则可能视为合法。但即便如此，公司也应确保规定的合理性和公平性，避免滥用权利。
总结：请一天假扣除两天工资的做法，在大多数情况下是不合法的。劳动者应了解自己的权利，并在遭遇此类情况时，积极采取合法途径维护自身权益。同时，用人单位也应严格遵守法律法规，确保工资支付的合法性与合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。