一天没上班扣两天工资的做法，在大多数情况下是不合法的，它侵犯了劳动者的合法权益。下面我将从多个角度为您详细分析：
一、法律依据与合法性分析
《中华人民共和国劳动法》第五十条：
- 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，用人单位在支付工资时，必须按照劳动合同约定或法定标准执行，不能随意扣除劳动者的工资。
扣款需合法合理：
- 用人单位可以因劳动者旷工或未出勤而扣除相应工资，但扣除的金额应与未出勤的天数相对应。即，旷工或未出勤一天，应扣除一天的工资。扣除两天的工资明显超出了实际未出勤的天数，属于不合理的扣款行为。
规章制度需合法且公示：
- 用人单位的规章制度必须符合国家法律法规的规定，且应经过民主程序制定并向劳动者公示。如果规章制度中规定了不合理的扣款条款（如旷工或未出勤一天扣两天工资），则该条款无效。
二、不合法情况举例
- 假设小李因个人原因一天未出勤，但单位却扣除了他两天的工资。如果这种扣除导致小李当月剩余工资低于当地月最低工资标准，那么这种做法就是违法的。
三、劳动者维权途径
面对“一天没上班扣两天工资”的不合法做法，劳动者可以采取以下措施维护自身权益：
与单位协商：
- 首先尝试与用人单位沟通，指出该规定的不合理和不合法性，要求按实际未出勤天数合理扣除工资，并返还多扣部分。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商不成，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权监督检查用人单位遵守劳动保障法律的情况，并对违法行为依法进行处理。
申请劳动仲裁：
- 若问题仍未得到解决，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付被克扣的工资及经济补偿。在申请仲裁时，劳动者需要提供相关的证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明自己的权益受到了侵害。
四、建议与提醒
了解自身权益：
- 劳动者应了解自己的合法权益和用人单位的规章制度，避免被不合理的扣款所侵害。
保留证据：
- 在遇到扣款问题时，劳动者应保留好相关证据（如工资条、考勤记录、与单位的沟通记录等），以便在维权时使用。
及时维权：
- 如果发现自己的工资被不合理扣除，劳动者应及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
综上所述，“一天没上班扣两天工资”的做法违反了劳动法的相关规定，侵犯了劳动者的合法权益。作为劳动者，应了解自己的权利，并在遭遇此类情况时，积极采取合法途径维护自身权益。如果您有任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。