公司更改工资条款结构降低工资是否违法，需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法调整薪资结构的情形
协商一致：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括薪资结构。
- 举例：若公司因业务调整需要，与您充分沟通并达成一致意见，将原本固定的薪资结构调整为基本工资加绩效奖金的形式，且调整后的总收入不低于原水平或当地最低工资标准，这种调整是合法的。
符合法律法规：
- 公司的薪资结构调整必须符合国家及地方相关法律法规的要求，如最低工资标准、加班工资计算等。
- 举例：若公司调整薪资结构后，基本工资仍不低于当地最低工资标准，且加班工资的计算方式也符合法律规定，那么这种调整是合法的。
基于经营需要：
- 公司因经营需要，如市场变化、业务调整等，对薪资结构进行合理调整，且调整后的薪资水平不低于当地最低工资标准，通常也被视为合法行为。
- 举例：若公司因市场萎缩，需要降低成本以维持运营，与您协商后调整薪资结构，但确保您的总收入不低于当地最低工资标准，这种调整是合法的。
二、违法调整薪资结构的情形及后果
未经协商一致：
- 如果公司单方面调整薪资结构，未与您进行协商或未达成一致意见，这种行为可能构成违法。
- 后果：您有权要求公司恢复原薪资结构，并可能主张经济补偿金。经济补偿金的计算通常按照您在公司的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向您支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向您支付半个月工资的经济补偿。
违反法律法规：
- 若公司的薪资结构调整违反了国家及地方相关法律法规，如降低基本工资至低于当地最低工资标准，或未按规定支付加班工资等，公司将面临法律责任。
- 后果：公司需支付赔偿金，并可能受到行政处罚。您也有权要求公司补足工资差额。
恶意降薪：
- 公司以不合理的理由恶意降低您薪资，损害您合法权益的，属于违法行为。
- 后果：您可以要求公司补足工资差额，并主张经济补偿金。同时，您还可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
三、应对建议
保留证据：
- 您应妥善保存与公司签订的劳动合同、工资条、银行流水等证据，以便在发生争议时维护自己的权益。
积极沟通：
- 面对公司调整薪资结构的情况，您应积极与公司沟通，了解调整的原因和依据，争取达成双方都能接受的解决方案。
寻求法律援助：
- 如果您认为公司的薪资结构调整存在违法行为，且无法与公司达成一致意见，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。在此过程中，如有需要，您可以随时向我咨询相关法律问题。
总结：公司更改工资条款结构降低工资是否违法，取决于是否与您协商一致、是否符合法律法规以及是否基于合理的经营需要。若公司未经协商一致或违反法律法规进行降薪，您有权维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。