核心结论：因身体原因在实习期直接离职，工资原则上应按实际出勤天数结算，但需注意离职程序合法性及可能涉及的违约金、赔偿金问题。以下分情况说明：
1. 工资结算：按实际出勤天数计算
根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
- 计算方式：工资=月工资标准÷21.75天（月计薪天数）×实际出勤天数。
- 例外情形：若劳动合同或实习协议中另有约定（如按项目结算），需按约定执行，但约定不得低于法定标准。
- 关键证据：保留考勤记录、工资条、劳动合同/实习协议等，以证明出勤情况及工资标准。
2. 离职程序合法性：提前通知或协商一致
- 试用期离职：根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。若未提前通知直接离职，可能被认定为违法解除，但工资仍需结算，用人单位不得克扣。
- 非试用期实习：若未签订劳动合同（仅签订实习协议），需按协议约定或双方协商处理离职程序。若协议未约定，建议提前沟通并留存书面证据（如微信、邮件），避免纠纷。
3. 违约金或赔偿金：需符合法定情形
- 服务期违约金：若用人单位为劳动者提供专项培训费用并约定服务期，劳动者违反服务期约定需支付违约金。但身体原因离职通常不构成违约，除非能证明离职与身体原因无关（如故意隐瞒病情）。
- 赔偿金：若因劳动者直接离职导致用人单位损失（如项目中断、招聘成本），用人单位可要求赔偿，但需举证损失金额及因果关系。身体原因导致的离职，用人单位一般难以主张赔偿。
4. 特殊情形：医疗期保护
若身体原因符合《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》的医疗期范围（如实习期患重病需长期治疗），劳动者可享受医疗期待遇，用人单位不得随意解除合同。但实习期通常不适用医疗期，除非双方约定或地方性法规另有规定。
行动建议：
- 与用人单位协商：说明身体原因，争取理解并协商工资结算及离职手续。
- 留存证据：保存病历、考勤记录、工资条等，以备维权使用。
- 投诉或仲裁：若用人单位克扣工资或拒不办理离职手续，可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。
如有进一步疑问（如具体地区政策、协议条款解读），可直接向我咨询，我会结合您的实际情况详细解答。