结论：主动离职时，公司是否有义务盖章需视具体情况而定，主要取决于离职证明、解除劳动合同协议等文件的性质及双方约定。以下从不同角度详细分析：
1. 离职证明的盖章义务
根据《劳动合同法》第五十条，用人单位应当在解除或终止劳动合同时出具离职证明，并加盖公司公章。这是公司的法定义务，无论员工是主动离职还是被动离职，公司均需履行。
- 法律依据：《劳动合同法》第五十条明确规定：“用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。”
- 实践建议：若公司拒绝出具或盖章，员工可向劳动监察部门投诉，或通过劳动仲裁要求公司履行义务。离职证明是员工办理失业登记、入职新公司的重要凭证，公司无权拒绝。
2. 解除劳动合同协议的盖章问题
若员工主动离职时与公司签订了《解除劳动合同协议》（如协商一致解除、提前通知解除等），协议需双方签字或盖章生效。
- 公司盖章的必要性：协议需体现双方合意，公司作为一方主体，盖章是确认协议效力的常见方式。但若公司法定代表人或授权代表签字，且协议内容合法，也可能被认定为有效（具体需结合协议形式和地方司法实践）。
- 员工注意事项：签署前务必核对协议内容（如离职时间、工资结算、竞业限制等），避免公司利用格式条款损害权益。若公司拒绝盖章或拖延，可要求书面说明理由，并保留沟通记录作为证据。
3. 其他文件的盖章要求
若员工需公司配合办理社保转移、档案调取等手续，可能涉及《社保转移申请表》《档案调档函》等文件。此类文件通常需公司盖章或经办人签字，但具体要求因地区和部门而异。
- 建议操作：提前向新单位或社保部门确认所需材料清单，与公司协商盖章流程。若公司无理拒绝，可依据《劳动合同法》第五十条主张权利。
4. 公司拒不盖章的应对措施
若公司以各种理由拒绝盖章（如“离职流程未完成”“领导未审批”等），员工可采取以下步骤：
- 书面催告：通过邮件、短信或书面函件要求公司限期盖章，并保留催告记录；
- 投诉举报：向当地劳动监察大队投诉（可通过12333热线或官网提交材料）；
- 劳动仲裁：以公司未履行法定义务为由申请仲裁，要求出具离职证明或确认协议效力；
- 诉讼途径：若仲裁未果，可向法院起诉（但劳动纠纷通常需先仲裁后诉讼）。
5. 特殊情形提示
- 试用期离职：根据《劳动合同法》第三十七条，试用期员工提前3日通知即可离职，公司仍需出具离职证明并盖章；
- 未签劳动合同：即使未签书面合同，员工离职时公司仍需出具离职证明（可依据工资记录、考勤等证明劳动关系）；
- 公司注销或破产：若公司已进入清算程序，员工可向清算组或管理人主张权利。
总结：主动离职时，公司对离职证明有法定盖章义务，对其他协议或文件则需根据双方约定和实际需要处理。若遇公司拒不配合，建议通过书面催告、投诉或仲裁维护权益。如有具体问题，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细方案。