公司确实在一定情况下有配合员工盖章的义务，但这一义务并非无条件且绝对的，而是需要根据具体情况来判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、公司配合员工盖章的义务来源
劳动合同或公司规章制度：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了公司需要为员工提供盖章等便利条件，那么公司就有义务按照约定履行。例如，员工因工作需要经常需要使用公司公章，而公司规章制度中明确规定了员工可以随时申请使用公章，并明确了申请流程和审批权限，那么公司就有义务按照规章制度配合员工盖章。
法律法规要求：
- 在某些特定情况下，法律法规可能要求公司为员工提供盖章等便利条件。例如，员工需要办理某些与工作相关的证件或手续，而办理这些证件或手续需要公司公章，那么公司就有义务配合员工完成盖章手续。
二、公司不配合员工盖章的可能后果
违反劳动合同或公司规章制度：
- 如果公司无正当理由拒绝配合员工盖章，且这一行为违反了劳动合同或公司规章制度中的约定，那么公司可能构成违约行为。员工有权要求公司承担违约责任，包括但不限于赔偿损失、恢复名誉等。
影响员工权益：
- 如果公司不配合员工盖章导致员工无法办理某些与工作相关的证件或手续，进而影响了员工的合法权益（如工资发放、社保缴纳等），那么员工有权向相关部门投诉或寻求法律援助。
三、公司配合员工盖章的注意事项
明确盖章用途和审批流程：
- 公司应建立完善的盖章管理制度，明确盖章的用途、审批流程和责任人。在员工申请盖章时，公司应要求员工提供明确的盖章用途和必要的证明材料，并按照审批流程进行审批。
保护公司利益：
- 在配合员工盖章时，公司应确保盖章行为不会损害公司的利益。例如，公司可以要求员工在盖章前签署承诺书或保证书，承诺盖章行为不会对公司造成任何损失或风险。
及时记录和归档：
- 公司应建立盖章记录制度，及时记录每次盖章的时间、地点、用途和审批人等信息。同时，公司还应将盖章相关的文件和资料进行归档保存，以备后续查阅和审计。
四、特殊情况下的处理
- 如果员工提出的盖章请求涉及违法或违规行为（如伪造文件、欺诈等），公司有权拒绝配合，并应立即向相关部门报告。
- 如果员工因个人原因（如离职、解雇等）需要公司配合盖章，但公司认为盖章行为可能对公司造成不利影响或风险，公司可以要求员工提供相应的担保或承诺，并在确保公司利益不受损害的前提下进行配合。
总结来说，公司在一定情况下确实有配合员工盖章的义务，但这一义务并非无条件且绝对的。公司应根据具体情况判断是否需要配合员工盖章，并建立完善的盖章管理制度以保护公司利益。如果员工对公司不配合盖章的行为有异议或认为自己的权益受到了侵害，可以直接向我咨询相关法律问题。