与公司发生矛盾时，公司不配合盖章的行为是否违法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：

一、公司盖章行为的法律性质

公司盖章，通常代表公司对文件内容的认可，是公司意志的体现。在法律上，公司盖章的行为往往被视为公司对相关事项的确认或承诺，具有一定的法律效力。因此，公司是否配合盖章，往往关系到相关事项能否顺利推进或得到法律认可。

二、公司不配合盖章的可能情形及法律分析

1. 合同或协议签订过程中

   • 若合同或协议内容合法合规，且双方已就主要条款达成一致：公司无正当理由拒绝配合盖章，可能构成违约行为。根据《民法典》的相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。在此情况下，你可以要求公司继续履行盖章义务，或者通过法律途径追究公司的违约责任。

   • 若合同或协议内容存在违法或显失公平等情形：公司拒绝盖章可能是出于合理抗辩，此时公司不配合盖章的行为可能不构成违法。但你需要仔细审查合同或协议内容，确保自身权益不受损害。

2. 公司内部管理或决策过程中

   • 若公司章程或内部管理制度明确规定了盖章流程和权限：公司不配合盖章可能违反了内部管理规定。但这种情况通常属于公司内部管理范畴，除非涉及外部法律关系或损害第三方利益，否则一般不直接构成违法。你可以通过公司内部渠道（如股东会、董事会等）寻求解决方案。

   • 若公司决策程序存在瑕疵或违法情形：例如，公司决策未经合法程序作出，或决策内容违反法律法规等，公司拒绝盖章可能是对违法决策的抵制。在此情况下，公司不配合盖章的行为可能具有正当性。

3. 涉及外部法律关系时

   • 若公司盖章行为涉及第三方权益：如公司作为合同一方与第三方签订合同，公司拒绝盖章可能导致合同无法成立或生效，从而损害第三方利益。在此情况下，公司不配合盖章的行为可能构成对第三方权益的侵害，需要承担相应的法律责任。

   • 若公司盖章行为涉及行政许可或审批等事项：如公司申请某项行政许可或审批需要提交盖章文件，公司拒绝盖章可能导致申请无法获得批准。虽然这种情况不直接构成违法，但可能影响公司的正常运营和发展。

三、建议与措施

1. 与公司沟通协商：首先尝试与公司进行友好沟通，了解公司拒绝盖章的具体原因和顾虑，寻求双方都能接受的解决方案。

2. 审查相关文件和合同：仔细审查需要盖章的文件和合同内容，确保其合法合规且符合双方利益。如有问题或争议点，及时与公司进行沟通和协商。

3. 寻求法律途径解决：若沟通协商无果，且你认为公司拒绝盖章的行为构成违法或违约，可以寻求法律途径解决。例如，向法院提起诉讼或申请仲裁等。

4. 咨询专业律师：在处理此类问题时，建议你咨询专业律师的意见和建议。律师可以根据具体情况为你提供针对性的法律分析和解决方案。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况和需求，为你提供专业、全面的法律服务。