结论：分包公司起诉总包后，钱是否会直接付给分包单位，这并非一个简单的是非问题，而是取决于多种因素，包括合同条款、法律规定以及案件的具体情况。以下我将从多个角度进行详细分析。

一、合同条款的约定

1. 直接支付条款：如果总包与分包之间的合同中明确约定了，在特定条件下（如分包公司完成特定工程部分并经总包验收合格后），总包应直接将款项支付给分包公司，那么在这种情况下，如果分包公司起诉总包并胜诉，法院可能会依据合同条款判决总包直接支付款项给分包公司。

2. 无直接支付条款：如果合同中没有这样的明确约定，那么通常总包会按照合同约定的支付流程，先将款项支付给与其有直接合同关系的上一手（可能是业主或更上一级的分包商），再由这些主体根据各自的合同关系进行后续支付。在这种情况下，分包公司起诉总包并胜诉后，款项可能不会直接支付给分包公司，而是需要按照合同约定的流程进行。

二、法律规定的适用

1. 合同相对性原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同主要在特定的合同当事人之间发生法律拘束力。这意味着，在一般情况下，分包公司不能直接要求总包将款项支付给自己，除非合同中有明确约定或法律有特别规定。

2. 实际施工人的特殊规定：然而，在建设工程领域，为了保护实际施工人的合法权益，《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第四十三条突破了合同相对性原则。该条规定允许实际施工人（如分包公司）在特定条件下直接起诉发包人（可能是业主或总包），并要求发包人在欠付范围内承担责任。但这一规定主要适用于实际施工人与发包人之间的关系，并不直接涉及总包与分包之间的支付问题。不过，如果分包公司能够证明自己属于实际施工人范畴，并且符合相关法律规定，那么在起诉总包并胜诉后，有可能通过法院的执行程序直接获得款项支付。

三、案件具体情况的影响

1. 证据的充分性：在分包公司起诉总包的案件中，证据的充分性至关重要。分包公司需要提供充分的证据证明自己已经完成了合同约定的工程部分，并且总包存在拖欠款项的行为。如果证据不足或存在争议，法院可能不会支持分包公司的诉讼请求。

2. 法院的裁判倾向：法院在裁判时会综合考虑多种因素，包括合同条款、法律规定、案件事实以及双方的过错程度等。因此，即使分包公司起诉总包并提供了充分的证据，法院也可能根据具体情况作出不同的裁判结果。例如，如果法院认为总包存在合理的抗辩理由（如分包公司完成的工程存在质量问题等），那么可能会驳回分包公司的诉讼请求或判决总包少支付款项。

建议：

• 审查合同条款：分包公司在起诉前应仔细审查与总包之间的合同条款，明确双方的权利和义务以及支付流程等关键信息。
• 收集证据材料：分包公司应积极收集与案件相关的证据材料，如合同、发票、验收报告、沟通记录等，以证明自己的主张。
• 咨询专业律师：在起诉前或诉讼过程中，分包公司应咨询专业律师的意见，以便更准确地了解自己的权利和责任以及诉讼风险等。

总之，分包公司起诉总包后钱是否会直接付给分包单位取决于多种因素。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。