企业不能私自帮助员工缴纳公交社保，这种行为不合法。以下从不同角度进行分析：

1. 社保缴纳的主体与范围
   根据《社会保险法》及相关规定，企业为员工缴纳社保是其法定义务，但缴纳范围仅限于养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险（即“五险”）。公交卡费用属于员工个人生活开支，不属于社保范畴，企业无权将其纳入社保缴纳项目。若企业擅自将公交费用与社保挂钩，可能涉嫌违规操作。

2. 企业行为的法律风险

   • 税务风险：社保费用需通过企业账户统一缴纳至社保机构，若企业将公交费用混入社保账户，可能被税务部门认定为“虚构社保项目”，面临补缴税款、滞纳金甚至罚款。
     
   • 劳动纠纷风险：员工可能以“企业未依法缴纳社保”为由主张权益，要求企业补缴社保差额或支付经济补偿金。
     
   • 行政处罚风险：社保部门有权对企业违规缴纳社保的行为进行查处，情节严重的可能吊销社保登记证或限制企业相关资质。

3. 合规建议

   • 明确社保与福利的界限：企业可通过合法途径为员工提供福利（如交通补贴），但需单独列支并依法纳税，不得与社保混为一谈。
     
   • 完善内部制度：制定明确的社保缴纳流程，确保所有操作符合《社会保险法》及地方政策要求。
     
   • 定期自查：定期委托专业机构对社保缴纳情况进行审计，及时发现并纠正潜在风险。

若企业已存在类似行为，建议立即停止并整改，避免法律风险进一步扩大。如有具体操作疑问，可进一步向我咨询。