工伤员工是否可以不发年终奖，需结合具体情况综合判断，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、公司规章制度与劳动合同的约定
明确规定年终奖发放条件：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了年终奖的发放条件，并且这些条件与工作绩效、出勤等挂钩，那么工伤职工在工伤治疗期间若无法正常出勤或完成工作任务，可能会影响其绩效考核，进而影响年终奖的发放。但前提是，这些规定必须合法、合理，不存在歧视性条款，且公司已明确告知劳动者。
- 举例：若公司规定年终奖发放需满足全年出勤率达到90%以上，而工伤职工因治疗需要长时间缺勤，导致出勤率不达标，此时公司可能根据规定不发放年终奖。
未明确规定年终奖发放条件：
- 当劳动合同和公司规章制度都没有对年终奖的发放作出明确规定时，从公平合理原则出发，工伤职工不应因其履行工作职责受伤而受到不合理的待遇差别。公司应综合考虑工伤职工的工伤情况、平时工作表现等因素，酌情决定年终奖的发放。
- 举例：若公司无明确年终奖发放规定，工伤职工在工伤前工作表现优秀，为公司做出显著贡献，此时公司应考虑其前期贡献，合理发放年终奖。
二、法律法规的保障
- 根据《工伤保险条例》第三十三条，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。年终奖作为工资福利待遇的一部分，理应包含在内，不应在工伤期间被扣除。
- 如果公司仅因职工工伤就拒绝发放年终奖，这可能构成对员工的歧视或不公平对待，违反了相关法律法规的精神和原则。员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
三、特殊情况的考虑
工伤职工的工作表现和贡献：
- 停工留薪期内：工伤职工虽因伤暂停工作，但如其在工伤前已为公司做出显著贡献，且年终奖与其工作表现直接相关，单位应考虑其前期贡献发放年终奖。
- 停工留薪期后：若工伤职工能够返回工作岗位并表现出色，与其他员工相当，则单位亦应发放年终奖；反之，如因伤情严重无法正常工作，单位可根据实际情况决定是否发放。
工伤原因：
- 如工伤系由职工本人严重违反操作规程或故意行为导致，且公司规章制度明确规定此情况下不发放年终奖，则单位有权不发放。但这种情况需有充分证据支持，且规章制度必须合法、合理。
四、建议与行动
工伤职工：
- 如果认为自己的年终奖权益受到了侵犯，可以先与公司进行协商沟通，要求其说明理由。
- 若协商不成，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维权。在维权过程中，注意收集相关证据，如劳动合同、公司规章制度、工伤认定书、医疗证明等。
公司：
- 在制定年终奖发放制度时，应遵循法律法规的强制性规定，并确保制度的合法性和合理性。
- 在处理工伤职工年终奖问题时，应综合考虑工伤职工的工伤情况、平时工作表现等因素，做到公平合理。
总结：工伤员工是否可以不发年终奖，需结合公司规章制度、劳动合同约定、工伤职工的工作表现和贡献以及特殊情况等多个因素进行综合判断。在处理此类问题时，应坚持公平合理原则，既要保障工伤职工的合法权益，也要兼顾用人单位的经营自主权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。