核心结论：即使员工最初同意工资低于当地最低工资标准，该约定也是无效的，员工发现后仍有权要求用人单位补足差额，并可依法维权。以下是具体分析：
最低工资标准的强制性
根据《劳动法》第四十八条及《最低工资规定》，最低工资标准是用人单位支付劳动者劳动报酬的法定底线，具有强制性。无论员工是否同意，用人单位支付的工资均不得低于当地最低工资标准。若低于该标准，即使员工签署了同意文件，该约定也因违反法律强制性规定而无效。
员工的权利与维权途径
- 要求补足差额：员工发现工资低于最低标准后，可向用人单位提出书面或口头要求，补足差额部分。
- 投诉举报：若用人单位拒绝，员工可向当地劳动监察部门投诉（如劳动保障监察大队），劳动部门将依法责令用人单位限期支付，并可能加付赔偿金（《劳动合同法》第八十五条）。
- 申请劳动仲裁：员工还可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张工资差额及经济补偿（如因拖欠工资被迫解除劳动合同的，可要求支付经济补偿金）。
- 诉讼途径：对仲裁结果不服的，可向法院提起诉讼。
用人单位的法律责任
- 行政处罚：劳动部门可责令用人单位限期支付差额，逾期不支付的，责令加付赔偿金（标准为应付金额的50%-100%）。
- 民事赔偿：若因工资低于最低标准导致员工生活困难或其他损失，用人单位可能需承担额外赔偿责任。
- 信用惩戒：严重违法用人单位可能被列入“黑名单”，影响企业信誉及招投标等资格。
实务建议
- 保留证据：员工应保存工资条、劳动合同、银行流水等证据，证明实际工资低于最低标准。
- 及时行动：发现侵权后尽快维权，避免超过1年仲裁时效（从知道或应当知道权利被侵害之日起计算）。
- 集体维权：若多名员工遭遇同类问题，可联合投诉或仲裁，增强维权力度。
总结：最低工资标准是法律对劳动者的基本保护，任何“员工同意”的约定均无法律效力。若您或身边人遇到此类问题，可直接向我咨询具体维权步骤，我将结合您所在地区的政策细节提供进一步指导。