可以申请劳动仲裁。针对您提出的“已发的两个月工资不合理，是否可以仲裁”的问题，以下是从不同角度的详细分析：
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动者与用人单位之间因劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险等发生的争议，均属于劳动争议范畴，可以依法申请劳动仲裁。工资作为劳动报酬的重要组成部分，若劳动者认为用人单位发放的工资不合理，即存在劳动争议，因此有权申请劳动仲裁。
二、工资不合理的具体情形与仲裁要点
工资低于最低工资标准：
- 若用人单位发放的工资低于当地最低工资标准，这明显违反了法律法规的规定，劳动者可以以此为由申请劳动仲裁，要求用人单位补足差额。
工资未包含应发项目：
- 工资应包含基本工资、奖金、津贴、补贴等应发项目。若用人单位在发放工资时未包含这些项目，或者故意少发、漏发，劳动者可以申请劳动仲裁，要求用人单位支付应得的工资。
工资计算方式不合理：
- 若用人单位在计算工资时存在错误，或者采用了不合理的计算方式，导致劳动者实际得到的工资低于应得水平，劳动者同样可以申请劳动仲裁，要求用人单位重新计算并支付工资。
三、申请劳动仲裁的流程与注意事项
准备证据材料：
- 在申请劳动仲裁前，劳动者需要准备充分的证据材料，如工资条、银行转账记录、劳动合同等，以证明用人单位发放的工资确实存在不合理之处。
提交仲裁申请：
- 劳动者应向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并附上相关证据材料。仲裁申请应明确载明劳动者的请求事项、事实和理由等。
参与仲裁程序：
- 在仲裁过程中，劳动者应积极参与，按照仲裁委员会的要求提供证据、陈述事实和理由等。同时，劳动者也有权对用人单位的答辩进行反驳和质证。
执行仲裁裁决：
- 若仲裁委员会作出有利于劳动者的裁决，用人单位应依法履行裁决义务。若用人单位不履行裁决义务，劳动者可以向人民法院申请强制执行。
四、建议与提醒
- 及时维权：若劳动者发现用人单位发放的工资不合理，应及时向用人单位提出异议，并保留好相关证据材料。若用人单位不予解决或解决不当，劳动者应尽快申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。
- 咨询专业意见：在申请劳动仲裁前或仲裁过程中，劳动者可以咨询专业律师的意见，以更好地了解自己的权利和义务以及仲裁程序的相关规定。
综上所述，若您认为已发的两个月工资不合理，完全可以依法申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。