法人在公司缴纳社保的同时，公司也必须按照法律规定向其支付工资（如果法人实际提供了劳动），这是合法且必要的。以下是对这一问题的详细分析：
一、工资支付与劳动关系的法律基础
工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，这是劳动者的基本权益，也是用人单位的基本义务。无论劳动者是否为公司法人，只要其实际为公司提供了劳动服务，公司就必须向其支付工资。这一原则同样适用于公司法人，如果法人实际参与了公司的日常经营管理或提供了其他形式的劳动服务，那么公司就有义务向其支付相应的工资。
二、社保缴纳与工资支付的关系
社保的缴纳是为了保障劳动者在面临特定风险（如疾病、工伤、失业等）时能够获得一定的经济保障，这是国家为了保障劳动者权益而制定的一项社会保障制度。社保的缴纳基于劳动关系和法律规定，与工资的支付没有直接的必然联系。也就是说，即使法人在公司缴纳了社保，也不意味着公司可以免除向其支付工资的法定责任（如果法人实际提供了劳动）。
三、不支付工资可能带来的法律风险
税务风险：如果法人只缴纳社保而不发工资，可能会引起税务机关的质疑，被认为存在不合理避税的嫌疑。税务机关有权对公司的税务情况进行审查，一旦被认定为避税行为，公司可能面临补缴税款、加收滞纳金甚至罚款等处罚。
劳动纠纷风险：虽然法人与公司可以通过协议约定不发工资（在法人未实际提供劳动的情况下），但如果后续双方发生矛盾，法人有可能反悔并主张劳动关系存续期间的工资。若协议存在瑕疵或者无法证明双方真实的约定，公司可能在劳动纠纷中处于不利地位，甚至需要承担法律责任。
四、实际操作建议
明确区分社保缴纳和工资支付：公司应明确区分这两个概念，并严格按照法律规定履行自己的义务。不要将社保缴纳作为不发工资的理由或借口。
确保协议的合法有效性和资料的完整性：在法人未实际提供劳动且双方有特殊约定的情况下，公司应确保协议的合法有效性和资料的完整性。协议应明确约定双方的权利和义务，包括工资支付、社保缴纳等事项，并留存好相关证据以备查证。
建立健全的财务管理和人事管理制度：公司应建立健全的财务管理和人事管理制度，确保按时足额地向劳动者（包括法人如果其实际提供劳动）支付工资和缴纳社保。这有助于维护公司的合法经营和劳动者的合法权益。
综上所述，法人在公司缴纳社保并不意味着可以不发工资。公司应严格遵守相关法律法规，确保既按时足额缴纳社保，又按时足额支付工资（如果法人实际提供了劳动），以维护劳动者的合法权益和公司的合法经营。