结论：上班超休扣全勤后，是否还需要另扣请假当天的工资，这主要取决于公司的规章制度以及劳动合同中的相关约定。如果公司规章制度或劳动合同中明确规定了超休扣全勤的同时还需扣请假当天工资，那么公司有权这样做；但如果未明确规定，则公司可能无权额外扣除请假当天的工资。
分析说明：
公司规章制度与劳动合同的约定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位与劳动者应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致的原则，签订劳动合同，并明确双方的权利和义务。
- 如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定了超休扣全勤的同时还需扣请假当天工资，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司有权按照这一规定执行。
- 反之，如果规章制度或劳动合同中未明确规定，或者规定与法律法规相抵触，那么公司可能无权额外扣除请假当天的工资。
全勤与工资扣除的合理性：
- 全勤通常指的是员工在一个月内未出现迟到、早退、旷工等违反公司规章制度的行为，公司为了鼓励员工保持全勤，可能会设立全勤奖。
- 如果员工因请假而未能保持全勤，公司扣除全勤奖是合理的。但是，如果公司在此基础上还额外扣除请假当天的工资，就需要考虑这一做法的合理性。
- 额外扣除工资可能涉及对员工劳动成果的剥夺，因此需要谨慎对待。如果公司确实需要这样做，应当在规章制度或劳动合同中明确规定，并确保这一规定不违反法律法规的强制性规定。
实际操作中的建议：
- 对于员工而言，在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资、福利、请假等方面的规定，确保自己的权益得到保障。
- 如果公司规章制度或劳动合同中存在不明确或不合理的地方，员工有权向公司提出异议，并要求公司进行修改或解释。
- 如果员工认为公司的做法违反了法律法规或劳动合同的规定，可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
特殊场景：
- 如果员工请假是因为公司的原因（如公司安排的任务导致员工无法正常休息），那么公司通常无权扣除请假当天的工资。
- 如果员工请假是因为个人原因（如病假、事假等），且公司规章制度或劳动合同中明确规定了请假期间的工资扣除标准，那么公司有权按照这一标准执行。
行动建议：
- 如果你对公司的工资扣除做法有疑问或不满，建议首先与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解公司的具体规定和做法。
- 如果沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，欢迎直接向我咨询。