结论：工厂预留员工工资用于社保代缴是否合法，需分情况讨论，关键在于是否符合“工资支付形式合法性”及“社保缴纳义务履行方式”的双重法律要求。具体分析如下：

1. 若预留工资行为符合“工资代扣代缴”的法定程序，则合法

根据《工资支付暂行规定》第15条及《社会保险法》第60条，用人单位可从员工工资中代扣代缴社保个人部分，但需满足以下条件：

• 程序合法性：需在劳动合同中明确约定“工资包含社保个人承担部分”，或通过书面形式告知员工代扣比例及金额（如工资条备注）；
• 金额合理性：代扣金额不得超过员工当月工资的20%（特殊情况需经劳动部门批准），且扣除后工资不得低于当地最低工资标准；
• 义务履行完整性：工厂需同步为员工缴纳社保单位部分（通常为员工工资的16%-20%，具体比例因地区而异），若仅预留个人部分而未缴纳单位部分，则涉嫌违法。

典型场景：若工厂与员工签订的劳动合同中明确约定“工资中包含社保个人承担部分，工厂按月代扣代缴”，且实际缴纳了单位部分，则该行为合法。

2. 若预留工资行为超出法定代扣范围，则可能违法

若工厂存在以下情形，则涉嫌违反《劳动法》第50条（工资必须以货币形式按月支付）及《社会保险法》第86条（未按时足额缴纳社保的处罚规定）：

• 全额预留工资：将员工全部工资预留用于社保缴纳，导致员工当月无实际收入（除非员工书面同意且工资不低于最低标准）；
• 未缴纳单位部分：仅预留员工个人部分工资，但未缴纳单位应承担的社保费用；
• 未履行告知义务：未通过劳动合同或书面形式告知员工代扣事项，导致员工对工资减少不知情。

典型场景：若工厂未与员工协商，直接从工资中扣除全部金额用于社保，且未缴纳单位部分，员工可向劳动监察部门投诉，要求工厂补发工资并补缴社保。

3. 特殊情形：员工自愿放弃社保的效力

若员工书面签署《自愿放弃社保声明》，工厂仍需承担法律风险：

• 声明无效性：根据《社会保险法》第58条，缴纳社保是用人单位的法定义务，员工自愿放弃的声明因违反法律强制性规定而无效；
• 工厂责任：即使员工放弃，工厂仍需为员工缴纳社保，否则可能面临劳动仲裁或行政处罚（如补缴社保、加收滞纳金）。

建议：工厂不应接受员工放弃社保的请求，而应通过合法代扣代缴程序履行义务。

总结与行动建议

1. 对工厂：需严格审查劳动合同条款，确保代扣代缴程序合法；定期核对社保缴纳记录，避免因未缴纳单位部分引发纠纷。
2. 对员工：若发现工资被不合理预留或社保未缴纳，可先与工厂协商；协商无果的，可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。

如有进一步疑问（如具体地区社保比例、工资代扣纠纷处理等），可直接向我咨询，我会结合您所在地区的法规提供更精准的建议。