结论：员工在公司涉嫌合同诈骗且老板逃跑的情况下，是否有罪主要取决于员工是否知情并参与了诈骗活动。若员工不知情或参与程度极低且未起关键作用，则通常不构成犯罪；反之，若员工明知并积极参与，或担任重要角色，则将承担相应的刑事责任。

详细分析：

1. 员工无罪的情况：

   • 完全不知情：如果员工对公司的合同诈骗行为完全不知情，仅按照正常工作职责行事，未参与任何诈骗环节，那么员工通常不构成犯罪。例如，公司的普通员工，如行政、人事或普通销售人员，若其工作性质与诈骗行为无直接关联，且对诈骗行为不知情，则不会被追究刑事责任。
   • 作用微小且不知情：即使员工在客观上可能为公司诈骗行为提供了一些辅助性工作，但因其不知情且这些工作对诈骗行为的完成所起作用微小，根据刑法原则，通常也不被认定为犯罪。

2. 员工有罪的情况：

   • 明知且积极参与：如果员工明知公司在进行合同诈骗，并积极参与策划、实施诈骗方案，如虚构事实、隐瞒真相以诱使受害者签订或履行合同，或协助公司收取诈骗所得款项等，那么员工将被认定为合同诈骗罪的共犯，需承担相应的刑事责任。
   • 担任重要角色或起到关键作用：即使员工没有直接参与诈骗行为的策划，但在诈骗过程中担任了重要角色，如财务人员明知公司业务存在诈骗性质仍负责管理和转移诈骗所得资金，为诈骗行为提供了关键的财务支持，那么员工也将被追究刑事责任。

3. 量刑标准：

   • 根据诈骗数额和情节严重程度，员工的刑事责任将有所不同。一般来说，诈骗数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；诈骗数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；诈骗数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。

4. 其他考虑因素：

   • 共同犯罪：如果“公司”实为诈骗行为的伪装，所有知情并参与诈骗活动的员工均被视为共同犯罪，需共同承担诈骗罪的刑罚责任。
   • 情节轻微：若员工虽然参与诈骗但情节相对轻微，法律上会考虑从轻处罚，甚至可能免予刑事处罚。这通常取决于员工在诈骗行为中的具体作用、参与程度以及是否有自首、立功等情节。

建议：

• 对于员工而言，如果发现自己所在的公司可能存在合同诈骗行为，应立即停止参与任何可能涉及诈骗的活动，并尽快向相关部门报告或咨询专业律师以了解自己的法律责任和风险。
• 如果员工已经被警方调查或拘留，应积极配合调查，如实陈述事实，并尽快委托专业律师为自己辩护，以维护自己的合法权益。

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