在建设工程合同中，若合同本身被认定为无效，那么其中约定的“先开票后付款”条款的效力问题，确实是一个需要细致分析的法律点。以下是对这一问题的详细解答：
一、“先票后款”条款在有效合同中的一般原则
在有效的建设工程合同中，“先票后款”条款通常被视为双方当事人的真实意思表示，且不违反法律法规的强制性规定，因此一般应认定为有效。这一条款体现了商业逻辑，即承包人需在发包人付款前提供合法有效的发票，作为付款的前提条件。
二、合同无效时“先票后款”条款的效力分析
合同无效的法律后果：
- 当建设工程合同被认定为无效时，合同中的大部分条款将失去法律效力，因为无效合同自始不具有法律约束力。
“先票后款”条款的独立性：
- 然而，并非合同中的所有条款都会因合同无效而当然无效。特别是那些不涉及合同效力核心要素，如不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗的条款，可能仍具有一定的独立性。
- “先票后款”条款主要涉及的是发票开具和付款的顺序问题，它并不直接决定合同的效力。因此，在合同无效的情况下，该条款的效力需要单独分析。
司法实践中的考量：
- 法院在审理相关案件时，会综合考虑多种因素，包括合同无效的原因、双方当事人的过错程度、实际履行情况、以及“先票后款”条款对双方权益的影响等。
- 如果“先票后款”条款是双方真实意思的表示，且在实际履行中并未对任何一方造成不公平或实质性损害，法院可能会倾向于认可该条款在合同无效后的某种程度的效力，尤其是当该条款被视为双方交易习惯或行业惯例时。
- 但另一方面，如果合同无效是由于一方当事人的严重过错导致的，且“先票后款”条款被视为该过错方利用合同优势地位设置的不公平条款，法院则可能会否定该条款的效力。
三、对合同双方的建议
签订合同时：
- 双方应明确约定开票与付款的具体顺序、时间节点以及未履行义务的法律后果等，以确保条款的明确性和可操作性。
- 避免设置过于苛刻或不公平的条款，以免在合同无效时引发纠纷。
合同履行过程中：
- 双方应保持诚信沟通，及时解决发票开具和款项支付等问题。
- 如果遇到合同无效的情况，应积极协商解决方案，避免纠纷升级。
发生纠纷时：
- 双方应积极寻求法律途径解决纠纷，并充分准备证据材料以维护自身合法权益。
- 在诉讼过程中，应尊重法院的裁判结果，并按照裁判结果履行相应义务。
综上所述，建设工程合同无效时，“先票后款”条款的效力并非绝对无效或有效，而是需要根据具体情况进行综合分析。合同双方在签订和履行合同时应充分考虑相关法律法规和司法实践的变化，以确保合同的合法性和有效性，并维护自身的合法权益。