结论前置：在合同约定“开具发票后付款”但未开具发票的情况下主张支付工程款，需分情况处理，具体如下：

1. 合同条款的效力与履行抗辩权
   根据《民法典》第525条（同时履行抗辩权）及第526条（先履行抗辩权），若合同明确约定“开具发票”为付款的前提条件（即先票后款），则付款方有权以“对方未履行先合同义务”为由拒绝支付工程款。此时，主张付款的一方需先完成发票开具义务，否则可能面临败诉风险。
   例外情形：若合同未明确约定发票开具与付款的先后顺序（如仅约定“付款时开具发票”），或双方实际履行中变更了条款（如口头同意先付款后补票），则付款方不得以未开票为由拒绝付款。

2. 发票开具的义务性质
   发票开具属于法定义务（《税收征收管理法》第21条）与合同附随义务的结合。若承包方（收款方）未开具发票，发包方（付款方）可单独通过税务机关投诉或提起民事诉讼要求其履行义务，但不能直接以此对抗工程款支付请求，除非合同明确将开票作为付款条件。
   实务建议：若合同未明确约定开票与付款的关联性，发包方应在支付工程款后要求承包方开具发票，并保留书面催告记录（如邮件、函件），以避免税务风险。

3. 工程款支付的主合同义务独立性
   工程款支付是发包方的主合同义务，其履行不应因附随义务（如开票）未完成而免除，除非合同明确约定“未开票构成付款障碍”。若承包方已实际完成工程并验收合格，仅因未开票而拒绝付款，可能被认定为“滥用抗辩权”，法院可能判决发包方支付工程款，同时要求承包方限期开票。
   风险提示：若承包方因未开票导致发包方无法抵扣税款或遭受其他损失，发包方可另行主张赔偿，但需举证损失与未开票的因果关系。

4. 实务操作建议

   • 对承包方：若发包方以未开票为由拒付，应首先检查合同条款，若条款未明确开票为付款条件，可立即补开发票并同步催款；若条款明确，则需先开票再主张权利。
     
   • 对发包方：若承包方未开票，应书面催告并留存证据，同时评估是否需通过税务途径解决，避免直接扣款引发诉讼风险。
     
   • 合同修订建议：未来合同中可明确约定“开票与付款互为独立义务”或“未开票的违约责任”（如按日计收违约金），以减少争议。

总结：未开具发票能否成为拒付工程款的合法理由，核心取决于合同条款的约定。若条款明确，则付款方有权抗辩；若未明确，则需以工程款支付为主义务，另行解决开票问题。建议双方根据实际履行情况协商处理，或通过法律途径明确权利义务。如有进一步疑问，可直接向我咨询。