关于您提出的“合同中约定先开票后付款是否有效”的问题，这确实是一个涉及商业习惯和法律规定的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、合同约定的法律效力
在合同中明确约定“先开票后付款”是具有法律效力的，前提是这种约定不违反法律法规的强制性规定。合同是双方意思自治的体现，一旦双方在合同中达成了这样的约定，就应当按照合同约定来履行各自的义务。这意味着，如果合同中明确规定了先开具发票作为付款的前提条件，那么付款方在收到合规发票后，就有义务按照约定支付款项。
二、法律层面的深入分析
主给付义务与附随义务的区别：
- 支付款项是合同中的主给付义务，它直接决定了合同核心目的的实现。
- 开具发票则是附随义务，其主要功能是保障国家税收和交易凭证的管理。
司法实践中的观点：
- 在司法实践中，法院通常认为，如果卖方已经按照合同约定履行了主要义务（如交付货物或提供服务），那么买方仅以未收到发票为由拒绝付款，可能构成违约。这是因为，开具发票虽然重要，但它并不是买方支付货款的前提条件，除非合同中有特别约定。
例外情形：
- 如果合同中将开票作为付款的明确前提条件，并且这种约定不违反法律强制性规定，那么买方在未收到合规发票的情况下，有权暂不付款。
- 另外，如果发票的开具直接影响到合同的履行（如税务政策要求凭发票办理验收手续），那么未开票也可能影响付款义务的履行。
三、实际操作建议
明确合同条款：
- 在合同中详细约定开票和付款的顺序、时间、条件以及违约责任等关键条款。这有助于确保双方在后续履行过程中有明确的依据，减少纠纷的发生。
充分沟通：
- 在签订合同前，双方应进行充分沟通，明确各自的权利和义务，以及可能出现的风险和应对措施。这有助于增强彼此之间的信任和理解，促进合同的顺利履行。
咨询专业律师：
- 为确保交易的安全性和合法性，最好能够咨询专业律师的意见。律师可以根据实际情况制定相应的风险防范措施，帮助双方更好地理解和履行合同义务。
总结：合同中约定“先开票后付款”在一般情况下是有效的，但具体效力还需结合合同条款、商业习惯以及法律法规的要求来判断。在实际操作中，建议双方谨慎行事，明确合同条款，充分沟通，并在必要时咨询专业律师的意见，以确保自身权益得到充分保障。