结论：动迁协议未约定房屋维修基金由谁缴纳时，房屋维修基金的承担主体需根据当地政策规定及实际情况来综合确定，可能由政府、拆迁方或被拆迁人（业主）承担，具体分析如下：
一、依据当地政策规定
政府承担：
- 在某些地区，政府为了推进拆迁安置工作的顺利进行，并减轻被拆迁人的经济负担，可能会主动承担维修基金的缴纳责任。这种做法在旧城改造等重大项目中较为常见，旨在提升居民的生活品质，确保其能安心入住新房。
被拆迁人（业主）承担：
- 部分地方政策则规定，被拆迁人在获得拆迁安置房后，需像购买普通商品房的业主一样，按照房屋建筑面积和一定的标准缴纳维修基金。这是为了保障房屋公共部位和共用设施设备的未来维修和养护需求。
二、依据实际情况及行业惯例
拆迁方承担：
- 在商业开发项目的拆迁安置中，拆迁方可能会将缴纳维修基金作为吸引被拆迁人签订协议的一种优惠条件，从而主动承担维修基金的缴纳责任。
被拆迁人（业主）承担：
- 若拆迁补偿相对丰厚，或者双方在协商过程中达成一致，被拆迁人可能会同意自行承担维修基金。这种情况下，被拆迁人作为房屋的未来使用者，承担维修基金也是合理的。
双方分担：
- 拆迁方和被拆迁人还可以约定按比例共同分担维修基金。具体比例应根据双方协商结果确定，并在相关协议中明确写明。
三、维修基金的具体缴纳标准
- 根据相关规定，业主需要按照所拥有的物业的建筑面积交存住宅专项维修资金。每平方米建筑面积交存的首期住宅专项维修资金的数额，通常为当地住宅建筑安装工程每平方米造价的5%至8%。具体数额由直辖市、市、县人民政府建设（房地产）主管部门根据本地区情况合理确定并公布，且会及时更新。
四、法律建议
查阅当地政策：
- 首先，建议查阅当地关于拆迁安置房维修基金缴纳的具体政策规定，以了解政府或相关部门对此问题的明确态度。
协商确定：
- 若当地政策未明确规定，建议拆迁方与被拆迁人进行协商，根据双方实际情况和利益诉求，共同确定维修基金的承担主体和缴纳标准。
明确协议条款：
- 在签订拆迁安置协议时，应明确约定维修基金的承担主体和缴纳标准，以避免未来产生不必要的纠纷。
咨询专业人士：
- 若对维修基金的缴纳问题存在疑问或争议，建议咨询专业律师或房地产相关机构，以获取更具体、更专业的法律建议。
五、可能法律后果
- 若双方未就维修基金的承担问题达成一致，且当地政策也未明确规定，则可能引发纠纷。在纠纷解决过程中，法院或仲裁机构可能会根据双方协商结果、行业惯例以及公平原则等因素，综合判断维修基金的承担主体。
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