结论：已经发放的绩效，在发现员工有违法行为后，一般不可以直接退回，但需根据具体情况和法律规定来综合判断处理方式。

分析说明：

1. 绩效的性质与发放：

   • 绩效通常是员工根据其工作表现、业绩或公司规定所获得的奖励性薪酬。
   • 一旦绩效发放给员工，即成为员工的合法收入，受到法律保护。

2. 员工违法行为的处理：

   • 如果员工存在违法行为，公司应首先依据内部规章制度或劳动合同进行调查和处理。
   • 违法行为若构成严重违反公司规章制度或劳动合同约定的情形，公司有权解除劳动合同，并可能根据规定要求员工承担相应责任。

3. 绩效退回的合法性：

   • 一般情况：已经发放的绩效，除非有明确的法律规定或合同约定允许在特定情况下退回（如员工因违法行为给公司造成重大损失，且该损失与绩效发放有直接关联），否则公司无权直接要求员工退回。
   • 特殊情况：如果员工的违法行为与绩效的发放存在直接关联，且该行为违反了公司规章制度或劳动合同中关于绩效发放的条件或规定，公司可能有权要求员工退回部分或全部绩效。但这种情况需要具体分析，并需有充分的证据支持。

4. 法律建议：

   • 审查合同与制度：公司应首先审查劳动合同和内部规章制度，明确关于绩效发放和员工违法行为的处理规定。
   • 收集证据：如果公司认为员工应退回绩效，应收集充分的证据证明员工的违法行为与绩效发放的直接关联性。
   • 协商与法律途径：在证据充分的情况下，公司可以尝试与员工协商退回绩效。如果协商无果，公司可以考虑通过法律途径解决，但需注意法律程序和证据要求。

后续行动建议：

• 如果公司发现员工有违法行为，并认为与绩效发放有关，建议首先咨询专业律师，了解具体法律情况和处理建议。
• 在处理过程中，公司应确保所有行动都符合法律规定，避免侵犯员工的合法权益。
• 如果决定要求员工退回绩效，公司应准备充分的证据，并遵循法律程序进行。

特殊场景：

• 如果员工的违法行为涉及刑事犯罪，且该犯罪行为与绩效发放有直接关联（如员工通过欺诈手段获得绩效），公司可能更有理由要求员工退回绩效，并可能通过法律途径追究员工的刑事责任和民事责任。

如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。