结论：加班工资一般不可以季度结算，而应按月及时支付给劳动者。但在某些特殊情况下，若满足特定条件并经过协商一致及审批程序，可能采用按季度结算的方式，不过这种情况较为少见且需严格遵循法律规定。
法律依据与解析
《中华人民共和国劳动法》第五十条：
- 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。加班工资作为工资的一部分，也应当遵循这一原则，按月支付给劳动者。
《工资支付暂行规定》第七条：
- 工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付。如遇节假日或休息日，则应提前在最近的工作日支付。工资至少每月支付一次，这进一步强调了工资（包括加班工资）应按月支付的原则。
加班工资的计算标准：
- 根据《劳动法》第四十四条，用人单位在安排劳动者延长工作时间、休息日工作且不能安排补休、法定休假日工作时，需按照法定标准支付高于正常工作时间工资的工资报酬。这些加班工资应当计入劳动者当月的工资总额，并按时支付。
特殊情况下的季度结算
一般情况下的不合法性：
- 在大多数情况下，加班工资应当按月支付，季度结算加班工资违反了《劳动法》和《工资支付暂行规定》的相关规定。用人单位若未按此规定支付，可能面临劳动行政部门的责令限期支付以及逾期不支付时的加付赔偿金处罚。
特殊情况下的合法性探讨：
- 虽然一般情况下不合法，但如果用人单位与劳动者在劳动合同、集体合同或通过其他民主协商程序中明确约定了加班工资可以按季度结算，且该约定不违反法律法规的强制性规定，同时事先已经知会了劳动者并确保不会损害劳动者的合法权益，那么这种做法可能是合法的。但这种情况较为少见，且需要严格满足上述条件。
劳动者权益保护
了解权益：
- 劳动者应了解自己的权益，包括加班工资的计算标准和支付时间等。如果用人单位未按时支付加班工资或存在其他违法行为，劳动者有权依法维护自己的合法权益。
维权途径：
- 劳动者可以首先与用人单位协商解决加班工资支付问题。如果协商不成，可以向当地劳动监察部门投诉或依法申请劳动仲裁。在必要时，还可以依据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，向人民法院申请支付令来维护自己的合法权益。
实际建议
对于劳动者：
- 在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于加班工资支付的部分。如果合同中有不明确或不合理的地方，应及时与用人单位沟通并协商修改。
- 在工作过程中，应保留好加班的证据，如加班通知、加班记录等，以便在需要时证明自己的加班情况。
对于用人单位：
- 应严格遵守法律法规的规定，按时足额支付劳动者的加班工资。如果确实需要采用按季度结算的方式，应事先与劳动者协商一致，并确保不会损害劳动者的合法权益。
- 应建立健全的加班管理制度，明确加班的审批程序、加班工资的计算标准等，以避免因加班工资支付问题引发的劳动争议。
综上所述，加班工资一般应按月支付给劳动者，以确保其合法权益得到及时保障。在特殊情况下，若需采用按季度结算的方式，必须满足特定条件并经过协商一致及审批程序。劳动者应了解自己的权益并依法维权，用人单位也应严格遵守法律法规的规定并建立健全的加班管理制度。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。