因加班增加的通勤费，法律上一般没有强制性的统一计算标准，但可以根据具体情况从以下角度分析计算方式：
劳动合同或公司规章制度有明确约定
如果劳动合同、集体合同或公司规章制度中明确约定了“加班期间通勤费由公司承担”或“按实际通勤费用报销”，则公司应按约定支付。计算方式通常以实际产生的费用为准（如打车发票、公共交通票据等），但需符合“合理性”原则（例如，加班至深夜选择打车回家属于合理，但加班至晚上9点仍选择高价专车可能不被认可）。
劳动合同或公司规章制度无约定，但属于“必要支出”
若公司未明确约定，但加班导致员工通勤方式发生实质性变化（如原本乘坐地铁，加班后需打车），且该支出是“为完成工作任务而产生的合理必要费用”，员工可主张公司承担。此时需提供证据证明费用与加班的关联性（如加班记录、打车发票、公共交通停运证明等），计算方式以实际合理支出为限。
地方性法规或政策有特殊规定
部分地区可能通过地方性法规或政策对加班通勤费作出规定。例如，某些城市规定“夜间加班（如22点后）的通勤费由公司承担”，或“特定行业（如外卖、快递）需报销通勤费”。此时需结合当地具体规定计算费用。
公司拒绝支付时的维权路径
若公司拒绝支付，员工可先与公司协商；协商不成，可向当地劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁。仲裁时需提供证据证明费用与加班的关联性及合理性，仲裁委将根据双方证据和法律规定裁决。
温馨提示：建议员工在加班时保留好相关证据（如加班审批单、打车发票、公共交通票据等），以便在主张权利时提供支持。若对具体计算方式或维权流程有疑问，可直接向我咨询，我会结合您的具体情况进一步分析。