公司规章制度经过职工大会商议过，一部分员工离职后，该规章制度对在职员工仍然有效。以下从多个角度为你详细分析：

规章制度效力基础

公司规章制度是公司为了规范内部管理、保障正常运营秩序而制定的，其效力来源于公司的合法制定程序以及内容本身的合法性、合理性。只要规章制度是按照法定程序制定，比如经过职工大会商议、讨论，且内容不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么它就对全体在职员工具有约束力。

员工离职不影响规章制度对在职员工的效力

员工离职是员工个人与公司解除劳动关系的行为，这一行为并不影响公司规章制度本身的效力。规章制度是针对公司整体运营和全体在职员工的管理规范，不会因为部分员工的离职而失效。例如，公司制定的考勤制度、奖惩制度等，只要这些制度在制定时符合法定程序，内容合法合理，那么无论是否有员工离职，这些制度都对在职员工继续有效。

特殊情况说明

虽然一般情况下规章制度对在职员工有效，但也存在一些特殊情况可能导致规章制度对部分在职员工不适用：

1. 规章制度内容违法或不合理：如果规章制度中的某些条款违反了法律法规的强制性规定，或者明显不合理，损害了员工的合法权益，那么这些条款将被认定为无效，对员工不具有约束力。例如，公司规定员工加班不给加班费，这一规定违反了《劳动法》中关于加班工资支付的规定，因此无效。
2. 规章制度未向员工公示或告知：根据法律规定，公司应当将规章制度向员工公示或者告知员工。如果公司没有履行这一义务，员工不知道规章制度的内容，那么该规章制度对员工不具有约束力。比如，公司制定了新的规章制度，但没有通过任何方式告知员工，员工在不知情的情况下违反了该制度，公司不能以此为由对员工进行处罚。
3. 针对特定员工的特殊约定：如果公司与某些员工在劳动合同或者其他协议中，对某些事项作出了与规章制度不同的特殊约定，那么在这些特定事项上，应当以双方的特殊约定为准。例如，公司规定所有员工每月加班不得超过20小时，但与某员工在劳动合同中约定该员工每月加班不得超过30小时，那么对于该员工，应当以劳动合同中的约定为准。

建议

为了确保公司规章制度的有效性和合法性，公司应当：

1. 严格按照法定程序制定规章制度：在制定规章制度时，要充分征求员工的意见和建议，经过职工大会或者职工代表大会讨论通过，确保制度的制定过程合法合规。
2. 及时向员工公示或告知规章制度：可以通过培训、发放手册、在公司内部公告栏张贴等方式，将规章制度的内容告知员工，让员工了解并遵守。
3. 定期审查和更新规章制度：随着法律法规的变化和公司实际情况的发展，要及时对规章制度进行审查和更新，确保制度的内容始终合法合理。

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